Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp12Q9D9M2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp12Q9D9M2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp12Q9D9M2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp12Q9D9M2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp12Q9D9M2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp12Q9D9M2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp12Q9D9M2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp12Q9D9M2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp12Q9D9M2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp12Q9D9M2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp12Q9D9M2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp12Q9D9M2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp12Q9D9M2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp12Q9D9M2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp12Q9D9M2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp12Q9D9M2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp12Q9D9M2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp12Q9D9M2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp12Q9D9M2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp12Q9D9M2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp12Q9D9M2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp12Q9D9M2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp12Q9D9M2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp12Q9D9M2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp12Q9D9M2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp12Q9D9M2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp12Q9D9M2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp12Q9D9M2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp12Q9D9M2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp12Q9D9M2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp12Q9D9M2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp12Q9D9M2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp12Q9D9M2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp12Q9D9M2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp12Q9D9M2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp12Q9D9M2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp12Q9D9M2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp12Q9D9M2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp12Q9D9M2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp12Q9D9M2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp12Q9D9M2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp12Q9D9M2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp12Q9D9M2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp12Q9D9M2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp12Q9D9M2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp12Q9D9M2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp12Q9D9M2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp12Q9D9M2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp12Q9D9M2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp12Q9D9M2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp12Q9D9M2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp12Q9D9M2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp12Q9D9M2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp12Q9D9M2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp12Q9D9M2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp12Q9D9M2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp12Q9D9M2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp12Q9D9M2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp12Q9D9M2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp12Q9D9M2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp12Q9D9M2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp12Q9D9M2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp12Q9D9M2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp12Q9D9M2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp12Q9D9M2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp12Q9D9M2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp12Q9D9M2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp12Q9D9M2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp12Q9D9M2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp12Q9D9M2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp12Q9D9M2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp12Q9D9M2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp12Q9D9M2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp12Q9D9M2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp12Q9D9M2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp12Q9D9M2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp12Q9D9M2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp12Q9D9M2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp12Q9D9M2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp12Q9D9M2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp12Q9D9M2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp12Q9D9M2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp12Q9D9M2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp12Q9D9M2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp12Q9D9M2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp12Q9D9M2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp12Q9D9M2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp12Q9D9M2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp12Q9D9M2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp12Q9D9M2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp12Q9D9M2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp12Q9D9M2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp12Q9D9M2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp12Q9D9M2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp12Q9D9M2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp12Q9D9M2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp12Q9D9M2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp12Q9D9M2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp12Q9D9M2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms