Protein–RNA interactions for Protein: Q9D979

Uncharacterized protein C17orf64 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D979 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D979 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9D979 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9D979 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9D979 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9D979 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9D979 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Q9D979 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Q9D979 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9D979 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D979 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D979 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D979 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D979 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D979 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D979 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D979 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D979 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9D979 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D979 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9D979 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9D979 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9D979 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D979 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D979 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D979 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D979 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D979 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D979 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D979 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9D979 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9D979 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9D979 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9D979 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9D979 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D979 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D979 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D979 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D979 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D979 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D979 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D979 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D979 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D979 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D979 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D979 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D979 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D979 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D979 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D979 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D979 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D979 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D979 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D979 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D979 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D979 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9D979 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9D979 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9D979 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D979 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D979 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D979 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D979 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D979 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D979 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D979 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9D979 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9D979 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9D979 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D979 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D979 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D979 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D979 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9D979 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D979 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D979 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9D979 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9D979 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9D979 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9D979 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9D979 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9D979 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9D979 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9D979 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D979 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D979 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D979 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D979 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D979 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D979 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D979 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D979 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D979 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D979 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D979 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D979 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D979 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D979 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D979 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D979 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms