Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8H7

Oma1, Metalloendopeptidase OMA1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oma1Q9D8H7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Oma1Q9D8H7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Oma1Q9D8H7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Oma1Q9D8H7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Oma1Q9D8H7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Oma1Q9D8H7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Oma1Q9D8H7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Oma1Q9D8H7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Oma1Q9D8H7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Oma1Q9D8H7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Oma1Q9D8H7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Oma1Q9D8H7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Oma1Q9D8H7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Oma1Q9D8H7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Oma1Q9D8H7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Oma1Q9D8H7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Oma1Q9D8H7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Oma1Q9D8H7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Oma1Q9D8H7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Oma1Q9D8H7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Oma1Q9D8H7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Oma1Q9D8H7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Oma1Q9D8H7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Oma1Q9D8H7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Oma1Q9D8H7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Oma1Q9D8H7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Oma1Q9D8H7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Oma1Q9D8H7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Oma1Q9D8H7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Oma1Q9D8H7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Oma1Q9D8H7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Oma1Q9D8H7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Oma1Q9D8H7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Oma1Q9D8H7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Oma1Q9D8H7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Oma1Q9D8H7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Oma1Q9D8H7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Oma1Q9D8H7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Oma1Q9D8H7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Oma1Q9D8H7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Oma1Q9D8H7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Oma1Q9D8H7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Oma1Q9D8H7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Oma1Q9D8H7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Oma1Q9D8H7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Oma1Q9D8H7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Oma1Q9D8H7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Oma1Q9D8H7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Oma1Q9D8H7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Oma1Q9D8H7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Oma1Q9D8H7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Oma1Q9D8H7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Oma1Q9D8H7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Oma1Q9D8H7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Oma1Q9D8H7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Oma1Q9D8H7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Oma1Q9D8H7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Oma1Q9D8H7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Oma1Q9D8H7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Oma1Q9D8H7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Oma1Q9D8H7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Oma1Q9D8H7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Oma1Q9D8H7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Oma1Q9D8H7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Oma1Q9D8H7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Oma1Q9D8H7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Oma1Q9D8H7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Oma1Q9D8H7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Oma1Q9D8H7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Oma1Q9D8H7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Oma1Q9D8H7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Oma1Q9D8H7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Oma1Q9D8H7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Oma1Q9D8H7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Oma1Q9D8H7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Oma1Q9D8H7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Oma1Q9D8H7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Oma1Q9D8H7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Oma1Q9D8H7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Oma1Q9D8H7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Oma1Q9D8H7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Oma1Q9D8H7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Oma1Q9D8H7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Oma1Q9D8H7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Oma1Q9D8H7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Oma1Q9D8H7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Oma1Q9D8H7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Oma1Q9D8H7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Oma1Q9D8H7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Oma1Q9D8H7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Oma1Q9D8H7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Oma1Q9D8H7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Oma1Q9D8H7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Oma1Q9D8H7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Oma1Q9D8H7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Oma1Q9D8H7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Oma1Q9D8H7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Oma1Q9D8H7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Oma1Q9D8H7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Oma1Q9D8H7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms