Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nop56Q9D6Z1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nop56Q9D6Z1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nop56Q9D6Z1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nop56Q9D6Z1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nop56Q9D6Z1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nop56Q9D6Z1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nop56Q9D6Z1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nop56Q9D6Z1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nop56Q9D6Z1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nop56Q9D6Z1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nop56Q9D6Z1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nop56Q9D6Z1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nop56Q9D6Z1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nop56Q9D6Z1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nop56Q9D6Z1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nop56Q9D6Z1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nop56Q9D6Z1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nop56Q9D6Z1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nop56Q9D6Z1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nop56Q9D6Z1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nop56Q9D6Z1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nop56Q9D6Z1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nop56Q9D6Z1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nop56Q9D6Z1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nop56Q9D6Z1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nop56Q9D6Z1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nop56Q9D6Z1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nop56Q9D6Z1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nop56Q9D6Z1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nop56Q9D6Z1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nop56Q9D6Z1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nop56Q9D6Z1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nop56Q9D6Z1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nop56Q9D6Z1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nop56Q9D6Z1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nop56Q9D6Z1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nop56Q9D6Z1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nop56Q9D6Z1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nop56Q9D6Z1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nop56Q9D6Z1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nop56Q9D6Z1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nop56Q9D6Z1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nop56Q9D6Z1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nop56Q9D6Z1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nop56Q9D6Z1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nop56Q9D6Z1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nop56Q9D6Z1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nop56Q9D6Z1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nop56Q9D6Z1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nop56Q9D6Z1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nop56Q9D6Z1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nop56Q9D6Z1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nop56Q9D6Z1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nop56Q9D6Z1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nop56Q9D6Z1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nop56Q9D6Z1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nop56Q9D6Z1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nop56Q9D6Z1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nop56Q9D6Z1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nop56Q9D6Z1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nop56Q9D6Z1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nop56Q9D6Z1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nop56Q9D6Z1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nop56Q9D6Z1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nop56Q9D6Z1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nop56Q9D6Z1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nop56Q9D6Z1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nop56Q9D6Z1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nop56Q9D6Z1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nop56Q9D6Z1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nop56Q9D6Z1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nop56Q9D6Z1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nop56Q9D6Z1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Nop56Q9D6Z1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nop56Q9D6Z1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nop56Q9D6Z1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nop56Q9D6Z1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nop56Q9D6Z1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nop56Q9D6Z1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nop56Q9D6Z1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nop56Q9D6Z1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nop56Q9D6Z1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nop56Q9D6Z1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nop56Q9D6Z1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nop56Q9D6Z1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nop56Q9D6Z1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nop56Q9D6Z1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nop56Q9D6Z1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nop56Q9D6Z1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nop56Q9D6Z1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nop56Q9D6Z1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nop56Q9D6Z1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nop56Q9D6Z1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nop56Q9D6Z1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nop56Q9D6Z1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nop56Q9D6Z1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nop56Q9D6Z1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nop56Q9D6Z1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nop56Q9D6Z1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms