Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V5

Cul5, Cullin-5, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul5Q9D5V5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cul5Q9D5V5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cul5Q9D5V5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cul5Q9D5V5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cul5Q9D5V5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cul5Q9D5V5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cul5Q9D5V5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cul5Q9D5V5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cul5Q9D5V5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cul5Q9D5V5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cul5Q9D5V5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cul5Q9D5V5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cul5Q9D5V5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cul5Q9D5V5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cul5Q9D5V5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Cul5Q9D5V5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cul5Q9D5V5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Cul5Q9D5V5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cul5Q9D5V5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cul5Q9D5V5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cul5Q9D5V5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cul5Q9D5V5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cul5Q9D5V5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cul5Q9D5V5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cul5Q9D5V5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cul5Q9D5V5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cul5Q9D5V5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cul5Q9D5V5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cul5Q9D5V5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cul5Q9D5V5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cul5Q9D5V5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cul5Q9D5V5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cul5Q9D5V5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cul5Q9D5V5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cul5Q9D5V5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cul5Q9D5V5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cul5Q9D5V5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cul5Q9D5V5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cul5Q9D5V5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cul5Q9D5V5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cul5Q9D5V5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cul5Q9D5V5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cul5Q9D5V5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cul5Q9D5V5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cul5Q9D5V5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Cul5Q9D5V5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cul5Q9D5V5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cul5Q9D5V5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cul5Q9D5V5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cul5Q9D5V5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cul5Q9D5V5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cul5Q9D5V5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cul5Q9D5V5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cul5Q9D5V5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cul5Q9D5V5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cul5Q9D5V5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cul5Q9D5V5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cul5Q9D5V5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cul5Q9D5V5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cul5Q9D5V5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cul5Q9D5V5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cul5Q9D5V5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cul5Q9D5V5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cul5Q9D5V5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cul5Q9D5V5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cul5Q9D5V5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cul5Q9D5V5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cul5Q9D5V5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cul5Q9D5V5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cul5Q9D5V5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cul5Q9D5V5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cul5Q9D5V5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cul5Q9D5V5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cul5Q9D5V5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cul5Q9D5V5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cul5Q9D5V5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cul5Q9D5V5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cul5Q9D5V5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cul5Q9D5V5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cul5Q9D5V5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cul5Q9D5V5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Cul5Q9D5V5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cul5Q9D5V5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cul5Q9D5V5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cul5Q9D5V5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cul5Q9D5V5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cul5Q9D5V5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cul5Q9D5V5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cul5Q9D5V5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cul5Q9D5V5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cul5Q9D5V5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cul5Q9D5V5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cul5Q9D5V5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cul5Q9D5V5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cul5Q9D5V5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cul5Q9D5V5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cul5Q9D5V5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cul5Q9D5V5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cul5Q9D5V5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cul5Q9D5V5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms