Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc83Q9D4V3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc83Q9D4V3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc83Q9D4V3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc83Q9D4V3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc83Q9D4V3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc83Q9D4V3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc83Q9D4V3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc83Q9D4V3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc83Q9D4V3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc83Q9D4V3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc83Q9D4V3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc83Q9D4V3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc83Q9D4V3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc83Q9D4V3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc83Q9D4V3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc83Q9D4V3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc83Q9D4V3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc83Q9D4V3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc83Q9D4V3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc83Q9D4V3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc83Q9D4V3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc83Q9D4V3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc83Q9D4V3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc83Q9D4V3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc83Q9D4V3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc83Q9D4V3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc83Q9D4V3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc83Q9D4V3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc83Q9D4V3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc83Q9D4V3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc83Q9D4V3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc83Q9D4V3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc83Q9D4V3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc83Q9D4V3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc83Q9D4V3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc83Q9D4V3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc83Q9D4V3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc83Q9D4V3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc83Q9D4V3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc83Q9D4V3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc83Q9D4V3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc83Q9D4V3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc83Q9D4V3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc83Q9D4V3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc83Q9D4V3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc83Q9D4V3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc83Q9D4V3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc83Q9D4V3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc83Q9D4V3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc83Q9D4V3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc83Q9D4V3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc83Q9D4V3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc83Q9D4V3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc83Q9D4V3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc83Q9D4V3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc83Q9D4V3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc83Q9D4V3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc83Q9D4V3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc83Q9D4V3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc83Q9D4V3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc83Q9D4V3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc83Q9D4V3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc83Q9D4V3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc83Q9D4V3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc83Q9D4V3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc83Q9D4V3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc83Q9D4V3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc83Q9D4V3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc83Q9D4V3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc83Q9D4V3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc83Q9D4V3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc83Q9D4V3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc83Q9D4V3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc83Q9D4V3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc83Q9D4V3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc83Q9D4V3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc83Q9D4V3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc83Q9D4V3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc83Q9D4V3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc83Q9D4V3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc83Q9D4V3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc83Q9D4V3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc83Q9D4V3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc83Q9D4V3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc83Q9D4V3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc83Q9D4V3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc83Q9D4V3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc83Q9D4V3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc83Q9D4V3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc83Q9D4V3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc83Q9D4V3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc83Q9D4V3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc83Q9D4V3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc83Q9D4V3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc83Q9D4V3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc83Q9D4V3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc83Q9D4V3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms