Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lonrf3Q9D4H7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Lonrf3Q9D4H7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lonrf3Q9D4H7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lonrf3Q9D4H7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lonrf3Q9D4H7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lonrf3Q9D4H7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lonrf3Q9D4H7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lonrf3Q9D4H7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lonrf3Q9D4H7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lonrf3Q9D4H7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lonrf3Q9D4H7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lonrf3Q9D4H7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lonrf3Q9D4H7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lonrf3Q9D4H7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lonrf3Q9D4H7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lonrf3Q9D4H7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lonrf3Q9D4H7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lonrf3Q9D4H7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lonrf3Q9D4H7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lonrf3Q9D4H7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lonrf3Q9D4H7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lonrf3Q9D4H7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lonrf3Q9D4H7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Lonrf3Q9D4H7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lonrf3Q9D4H7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lonrf3Q9D4H7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lonrf3Q9D4H7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lonrf3Q9D4H7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lonrf3Q9D4H7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lonrf3Q9D4H7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Lonrf3Q9D4H7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lonrf3Q9D4H7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lonrf3Q9D4H7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lonrf3Q9D4H7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lonrf3Q9D4H7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lonrf3Q9D4H7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lonrf3Q9D4H7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lonrf3Q9D4H7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lonrf3Q9D4H7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lonrf3Q9D4H7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lonrf3Q9D4H7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lonrf3Q9D4H7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lonrf3Q9D4H7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lonrf3Q9D4H7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lonrf3Q9D4H7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lonrf3Q9D4H7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Lonrf3Q9D4H7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lonrf3Q9D4H7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lonrf3Q9D4H7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lonrf3Q9D4H7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Lonrf3Q9D4H7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lonrf3Q9D4H7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lonrf3Q9D4H7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lonrf3Q9D4H7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lonrf3Q9D4H7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lonrf3Q9D4H7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lonrf3Q9D4H7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lonrf3Q9D4H7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lonrf3Q9D4H7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lonrf3Q9D4H7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lonrf3Q9D4H7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lonrf3Q9D4H7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lonrf3Q9D4H7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lonrf3Q9D4H7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lonrf3Q9D4H7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lonrf3Q9D4H7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lonrf3Q9D4H7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lonrf3Q9D4H7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lonrf3Q9D4H7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lonrf3Q9D4H7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lonrf3Q9D4H7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lonrf3Q9D4H7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lonrf3Q9D4H7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lonrf3Q9D4H7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Lonrf3Q9D4H7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Lonrf3Q9D4H7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Lonrf3Q9D4H7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lonrf3Q9D4H7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Lonrf3Q9D4H7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lonrf3Q9D4H7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lonrf3Q9D4H7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lonrf3Q9D4H7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.52■■■□□ 2
Lonrf3Q9D4H7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Lonrf3Q9D4H7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lonrf3Q9D4H7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lonrf3Q9D4H7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Lonrf3Q9D4H7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lonrf3Q9D4H7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lonrf3Q9D4H7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lonrf3Q9D4H7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms