Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trmt44Q9D2Q2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trmt44Q9D2Q2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trmt44Q9D2Q2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trmt44Q9D2Q2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trmt44Q9D2Q2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trmt44Q9D2Q2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trmt44Q9D2Q2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trmt44Q9D2Q2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trmt44Q9D2Q2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trmt44Q9D2Q2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trmt44Q9D2Q2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trmt44Q9D2Q2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trmt44Q9D2Q2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trmt44Q9D2Q2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trmt44Q9D2Q2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trmt44Q9D2Q2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trmt44Q9D2Q2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trmt44Q9D2Q2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trmt44Q9D2Q2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trmt44Q9D2Q2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trmt44Q9D2Q2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Trmt44Q9D2Q2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Trmt44Q9D2Q2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trmt44Q9D2Q2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trmt44Q9D2Q2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trmt44Q9D2Q2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trmt44Q9D2Q2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trmt44Q9D2Q2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trmt44Q9D2Q2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trmt44Q9D2Q2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trmt44Q9D2Q2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trmt44Q9D2Q2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trmt44Q9D2Q2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trmt44Q9D2Q2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trmt44Q9D2Q2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trmt44Q9D2Q2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Trmt44Q9D2Q2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trmt44Q9D2Q2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trmt44Q9D2Q2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Trmt44Q9D2Q2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trmt44Q9D2Q2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trmt44Q9D2Q2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trmt44Q9D2Q2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trmt44Q9D2Q2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trmt44Q9D2Q2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trmt44Q9D2Q2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trmt44Q9D2Q2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Trmt44Q9D2Q2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trmt44Q9D2Q2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trmt44Q9D2Q2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trmt44Q9D2Q2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trmt44Q9D2Q2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trmt44Q9D2Q2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trmt44Q9D2Q2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trmt44Q9D2Q2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trmt44Q9D2Q2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Trmt44Q9D2Q2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Trmt44Q9D2Q2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Trmt44Q9D2Q2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trmt44Q9D2Q2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trmt44Q9D2Q2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trmt44Q9D2Q2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trmt44Q9D2Q2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trmt44Q9D2Q2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trmt44Q9D2Q2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trmt44Q9D2Q2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trmt44Q9D2Q2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Trmt44Q9D2Q2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trmt44Q9D2Q2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trmt44Q9D2Q2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Trmt44Q9D2Q2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trmt44Q9D2Q2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trmt44Q9D2Q2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trmt44Q9D2Q2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trmt44Q9D2Q2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trmt44Q9D2Q2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trmt44Q9D2Q2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trmt44Q9D2Q2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trmt44Q9D2Q2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trmt44Q9D2Q2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trmt44Q9D2Q2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trmt44Q9D2Q2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trmt44Q9D2Q2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trmt44Q9D2Q2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trmt44Q9D2Q2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trmt44Q9D2Q2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trmt44Q9D2Q2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trmt44Q9D2Q2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trmt44Q9D2Q2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Trmt44Q9D2Q2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trmt44Q9D2Q2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trmt44Q9D2Q2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trmt44Q9D2Q2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trmt44Q9D2Q2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trmt44Q9D2Q2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trmt44Q9D2Q2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trmt44Q9D2Q2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trmt44Q9D2Q2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trmt44Q9D2Q2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms