Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snapc3Q9D2C9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snapc3Q9D2C9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snapc3Q9D2C9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snapc3Q9D2C9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snapc3Q9D2C9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snapc3Q9D2C9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snapc3Q9D2C9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.3■■□□□ 1
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Snapc3Q9D2C9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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Snapc3Q9D2C9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snapc3Q9D2C9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snapc3Q9D2C9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snapc3Q9D2C9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Snapc3Q9D2C9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snapc3Q9D2C9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snapc3Q9D2C9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snapc3Q9D2C9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snapc3Q9D2C9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snapc3Q9D2C9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snapc3Q9D2C9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snapc3Q9D2C9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snapc3Q9D2C9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snapc3Q9D2C9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snapc3Q9D2C9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snapc3Q9D2C9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snapc3Q9D2C9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snapc3Q9D2C9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snapc3Q9D2C9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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