Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snapc3Q9D2C9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snapc3Q9D2C9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snapc3Q9D2C9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snapc3Q9D2C9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snapc3Q9D2C9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snapc3Q9D2C9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snapc3Q9D2C9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snapc3Q9D2C9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snapc3Q9D2C9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Snapc3Q9D2C9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snapc3Q9D2C9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snapc3Q9D2C9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snapc3Q9D2C9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Snapc3Q9D2C9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snapc3Q9D2C9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snapc3Q9D2C9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snapc3Q9D2C9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snapc3Q9D2C9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snapc3Q9D2C9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snapc3Q9D2C9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snapc3Q9D2C9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snapc3Q9D2C9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snapc3Q9D2C9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snapc3Q9D2C9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snapc3Q9D2C9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snapc3Q9D2C9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snapc3Q9D2C9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snapc3Q9D2C9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms