Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bcas2Q9D287 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bcas2Q9D287 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bcas2Q9D287 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bcas2Q9D287 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bcas2Q9D287 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bcas2Q9D287 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bcas2Q9D287 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bcas2Q9D287 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bcas2Q9D287 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bcas2Q9D287 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bcas2Q9D287 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bcas2Q9D287 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bcas2Q9D287 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bcas2Q9D287 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bcas2Q9D287 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Bcas2Q9D287 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bcas2Q9D287 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcas2Q9D287 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcas2Q9D287 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcas2Q9D287 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcas2Q9D287 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcas2Q9D287 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcas2Q9D287 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcas2Q9D287 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcas2Q9D287 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcas2Q9D287 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Bcas2Q9D287 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bcas2Q9D287 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bcas2Q9D287 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcas2Q9D287 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcas2Q9D287 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcas2Q9D287 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcas2Q9D287 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcas2Q9D287 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcas2Q9D287 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcas2Q9D287 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcas2Q9D287 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcas2Q9D287 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcas2Q9D287 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcas2Q9D287 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcas2Q9D287 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcas2Q9D287 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bcas2Q9D287 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bcas2Q9D287 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bcas2Q9D287 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bcas2Q9D287 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bcas2Q9D287 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bcas2Q9D287 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bcas2Q9D287 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Bcas2Q9D287 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bcas2Q9D287 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bcas2Q9D287 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Bcas2Q9D287 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bcas2Q9D287 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bcas2Q9D287 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bcas2Q9D287 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bcas2Q9D287 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Bcas2Q9D287 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bcas2Q9D287 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bcas2Q9D287 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bcas2Q9D287 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bcas2Q9D287 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bcas2Q9D287 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bcas2Q9D287 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bcas2Q9D287 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bcas2Q9D287 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bcas2Q9D287 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Bcas2Q9D287 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcas2Q9D287 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcas2Q9D287 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bcas2Q9D287 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bcas2Q9D287 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bcas2Q9D287 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bcas2Q9D287 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bcas2Q9D287 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bcas2Q9D287 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bcas2Q9D287 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bcas2Q9D287 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bcas2Q9D287 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bcas2Q9D287 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bcas2Q9D287 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcas2Q9D287 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcas2Q9D287 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcas2Q9D287 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcas2Q9D287 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcas2Q9D287 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcas2Q9D287 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcas2Q9D287 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcas2Q9D287 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcas2Q9D287 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcas2Q9D287 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcas2Q9D287 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcas2Q9D287 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcas2Q9D287 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcas2Q9D287 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcas2Q9D287 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcas2Q9D287 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcas2Q9D287 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcas2Q9D287 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms