Protein–RNA interactions for Protein: Q9D253

9330161L09Rik, RIKEN cDNA 9330161L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9330161L09RikQ9D253 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
9330161L09RikQ9D253 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
9330161L09RikQ9D253 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
9330161L09RikQ9D253 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
9330161L09RikQ9D253 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
9330161L09RikQ9D253 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
9330161L09RikQ9D253 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
9330161L09RikQ9D253 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
9330161L09RikQ9D253 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
9330161L09RikQ9D253 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
9330161L09RikQ9D253 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
9330161L09RikQ9D253 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
9330161L09RikQ9D253 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
9330161L09RikQ9D253 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
9330161L09RikQ9D253 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
9330161L09RikQ9D253 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
9330161L09RikQ9D253 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
9330161L09RikQ9D253 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
9330161L09RikQ9D253 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
9330161L09RikQ9D253 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
9330161L09RikQ9D253 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
9330161L09RikQ9D253 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
9330161L09RikQ9D253 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
9330161L09RikQ9D253 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
9330161L09RikQ9D253 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
9330161L09RikQ9D253 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
9330161L09RikQ9D253 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
9330161L09RikQ9D253 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
9330161L09RikQ9D253 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
9330161L09RikQ9D253 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
9330161L09RikQ9D253 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
9330161L09RikQ9D253 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
9330161L09RikQ9D253 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
9330161L09RikQ9D253 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
9330161L09RikQ9D253 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
9330161L09RikQ9D253 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
9330161L09RikQ9D253 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
9330161L09RikQ9D253 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
9330161L09RikQ9D253 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
9330161L09RikQ9D253 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
9330161L09RikQ9D253 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
9330161L09RikQ9D253 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
9330161L09RikQ9D253 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
9330161L09RikQ9D253 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
9330161L09RikQ9D253 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
9330161L09RikQ9D253 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
9330161L09RikQ9D253 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
9330161L09RikQ9D253 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
9330161L09RikQ9D253 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
9330161L09RikQ9D253 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
9330161L09RikQ9D253 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
9330161L09RikQ9D253 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
9330161L09RikQ9D253 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
9330161L09RikQ9D253 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
9330161L09RikQ9D253 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
9330161L09RikQ9D253 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
9330161L09RikQ9D253 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
9330161L09RikQ9D253 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
9330161L09RikQ9D253 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
9330161L09RikQ9D253 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
9330161L09RikQ9D253 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
9330161L09RikQ9D253 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
9330161L09RikQ9D253 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
9330161L09RikQ9D253 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
9330161L09RikQ9D253 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
9330161L09RikQ9D253 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
9330161L09RikQ9D253 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
9330161L09RikQ9D253 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
9330161L09RikQ9D253 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
9330161L09RikQ9D253 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
9330161L09RikQ9D253 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
9330161L09RikQ9D253 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
9330161L09RikQ9D253 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
9330161L09RikQ9D253 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
9330161L09RikQ9D253 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
9330161L09RikQ9D253 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
9330161L09RikQ9D253 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
9330161L09RikQ9D253 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
9330161L09RikQ9D253 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
9330161L09RikQ9D253 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
9330161L09RikQ9D253 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
9330161L09RikQ9D253 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
9330161L09RikQ9D253 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
9330161L09RikQ9D253 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
9330161L09RikQ9D253 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
9330161L09RikQ9D253 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
9330161L09RikQ9D253 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
9330161L09RikQ9D253 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
9330161L09RikQ9D253 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
9330161L09RikQ9D253 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
9330161L09RikQ9D253 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
9330161L09RikQ9D253 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
9330161L09RikQ9D253 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
9330161L09RikQ9D253 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
9330161L09RikQ9D253 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
9330161L09RikQ9D253 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
9330161L09RikQ9D253 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
9330161L09RikQ9D253 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
9330161L09RikQ9D253 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
9330161L09RikQ9D253 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms