Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Z3

Fam173b, Protein FAM173B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam173bQ9D1Z3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam173bQ9D1Z3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam173bQ9D1Z3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam173bQ9D1Z3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam173bQ9D1Z3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam173bQ9D1Z3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam173bQ9D1Z3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam173bQ9D1Z3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam173bQ9D1Z3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam173bQ9D1Z3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam173bQ9D1Z3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam173bQ9D1Z3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam173bQ9D1Z3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam173bQ9D1Z3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam173bQ9D1Z3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam173bQ9D1Z3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam173bQ9D1Z3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam173bQ9D1Z3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam173bQ9D1Z3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam173bQ9D1Z3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam173bQ9D1Z3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam173bQ9D1Z3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam173bQ9D1Z3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam173bQ9D1Z3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam173bQ9D1Z3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam173bQ9D1Z3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam173bQ9D1Z3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam173bQ9D1Z3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam173bQ9D1Z3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam173bQ9D1Z3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam173bQ9D1Z3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam173bQ9D1Z3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam173bQ9D1Z3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam173bQ9D1Z3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam173bQ9D1Z3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam173bQ9D1Z3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam173bQ9D1Z3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam173bQ9D1Z3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam173bQ9D1Z3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam173bQ9D1Z3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam173bQ9D1Z3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam173bQ9D1Z3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam173bQ9D1Z3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam173bQ9D1Z3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam173bQ9D1Z3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam173bQ9D1Z3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam173bQ9D1Z3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam173bQ9D1Z3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam173bQ9D1Z3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam173bQ9D1Z3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam173bQ9D1Z3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam173bQ9D1Z3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam173bQ9D1Z3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam173bQ9D1Z3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam173bQ9D1Z3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam173bQ9D1Z3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam173bQ9D1Z3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam173bQ9D1Z3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam173bQ9D1Z3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam173bQ9D1Z3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam173bQ9D1Z3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam173bQ9D1Z3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam173bQ9D1Z3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam173bQ9D1Z3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam173bQ9D1Z3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam173bQ9D1Z3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam173bQ9D1Z3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam173bQ9D1Z3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam173bQ9D1Z3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam173bQ9D1Z3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam173bQ9D1Z3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam173bQ9D1Z3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam173bQ9D1Z3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam173bQ9D1Z3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam173bQ9D1Z3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam173bQ9D1Z3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam173bQ9D1Z3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam173bQ9D1Z3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam173bQ9D1Z3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam173bQ9D1Z3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam173bQ9D1Z3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam173bQ9D1Z3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam173bQ9D1Z3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam173bQ9D1Z3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam173bQ9D1Z3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam173bQ9D1Z3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam173bQ9D1Z3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam173bQ9D1Z3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam173bQ9D1Z3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam173bQ9D1Z3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam173bQ9D1Z3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam173bQ9D1Z3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam173bQ9D1Z3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam173bQ9D1Z3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam173bQ9D1Z3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam173bQ9D1Z3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam173bQ9D1Z3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam173bQ9D1Z3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam173bQ9D1Z3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam173bQ9D1Z3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms