Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Y9

Shisal2b, Protein shisa-like-2B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2bQ9D1Y9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shisal2bQ9D1Y9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shisal2bQ9D1Y9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Shisal2bQ9D1Y9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shisal2bQ9D1Y9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shisal2bQ9D1Y9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shisal2bQ9D1Y9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shisal2bQ9D1Y9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shisal2bQ9D1Y9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shisal2bQ9D1Y9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shisal2bQ9D1Y9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shisal2bQ9D1Y9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shisal2bQ9D1Y9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shisal2bQ9D1Y9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shisal2bQ9D1Y9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shisal2bQ9D1Y9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Shisal2bQ9D1Y9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shisal2bQ9D1Y9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Shisal2bQ9D1Y9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Shisal2bQ9D1Y9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Shisal2bQ9D1Y9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shisal2bQ9D1Y9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shisal2bQ9D1Y9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shisal2bQ9D1Y9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Shisal2bQ9D1Y9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shisal2bQ9D1Y9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shisal2bQ9D1Y9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shisal2bQ9D1Y9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shisal2bQ9D1Y9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shisal2bQ9D1Y9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shisal2bQ9D1Y9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shisal2bQ9D1Y9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shisal2bQ9D1Y9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Shisal2bQ9D1Y9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shisal2bQ9D1Y9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shisal2bQ9D1Y9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shisal2bQ9D1Y9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shisal2bQ9D1Y9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shisal2bQ9D1Y9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shisal2bQ9D1Y9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shisal2bQ9D1Y9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shisal2bQ9D1Y9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shisal2bQ9D1Y9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shisal2bQ9D1Y9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shisal2bQ9D1Y9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Shisal2bQ9D1Y9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisal2bQ9D1Y9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisal2bQ9D1Y9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisal2bQ9D1Y9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shisal2bQ9D1Y9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shisal2bQ9D1Y9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shisal2bQ9D1Y9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shisal2bQ9D1Y9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shisal2bQ9D1Y9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shisal2bQ9D1Y9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shisal2bQ9D1Y9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisal2bQ9D1Y9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisal2bQ9D1Y9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisal2bQ9D1Y9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisal2bQ9D1Y9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shisal2bQ9D1Y9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shisal2bQ9D1Y9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shisal2bQ9D1Y9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shisal2bQ9D1Y9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shisal2bQ9D1Y9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shisal2bQ9D1Y9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shisal2bQ9D1Y9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shisal2bQ9D1Y9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shisal2bQ9D1Y9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shisal2bQ9D1Y9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms