Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chordc1Q9D1P4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chordc1Q9D1P4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chordc1Q9D1P4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chordc1Q9D1P4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chordc1Q9D1P4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Chordc1Q9D1P4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chordc1Q9D1P4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chordc1Q9D1P4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chordc1Q9D1P4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chordc1Q9D1P4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chordc1Q9D1P4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chordc1Q9D1P4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chordc1Q9D1P4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chordc1Q9D1P4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Chordc1Q9D1P4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chordc1Q9D1P4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chordc1Q9D1P4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chordc1Q9D1P4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Chordc1Q9D1P4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chordc1Q9D1P4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chordc1Q9D1P4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chordc1Q9D1P4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chordc1Q9D1P4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chordc1Q9D1P4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chordc1Q9D1P4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Chordc1Q9D1P4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chordc1Q9D1P4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chordc1Q9D1P4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chordc1Q9D1P4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Chordc1Q9D1P4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chordc1Q9D1P4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chordc1Q9D1P4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chordc1Q9D1P4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chordc1Q9D1P4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chordc1Q9D1P4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chordc1Q9D1P4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chordc1Q9D1P4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chordc1Q9D1P4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chordc1Q9D1P4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chordc1Q9D1P4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chordc1Q9D1P4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chordc1Q9D1P4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chordc1Q9D1P4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chordc1Q9D1P4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chordc1Q9D1P4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chordc1Q9D1P4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Chordc1Q9D1P4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chordc1Q9D1P4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chordc1Q9D1P4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chordc1Q9D1P4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chordc1Q9D1P4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chordc1Q9D1P4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chordc1Q9D1P4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chordc1Q9D1P4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chordc1Q9D1P4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chordc1Q9D1P4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chordc1Q9D1P4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chordc1Q9D1P4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chordc1Q9D1P4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chordc1Q9D1P4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chordc1Q9D1P4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chordc1Q9D1P4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chordc1Q9D1P4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chordc1Q9D1P4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chordc1Q9D1P4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chordc1Q9D1P4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chordc1Q9D1P4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chordc1Q9D1P4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chordc1Q9D1P4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chordc1Q9D1P4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chordc1Q9D1P4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chordc1Q9D1P4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chordc1Q9D1P4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Chordc1Q9D1P4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chordc1Q9D1P4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chordc1Q9D1P4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chordc1Q9D1P4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chordc1Q9D1P4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chordc1Q9D1P4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chordc1Q9D1P4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chordc1Q9D1P4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chordc1Q9D1P4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chordc1Q9D1P4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chordc1Q9D1P4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chordc1Q9D1P4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chordc1Q9D1P4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chordc1Q9D1P4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chordc1Q9D1P4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chordc1Q9D1P4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Chordc1Q9D1P4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chordc1Q9D1P4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chordc1Q9D1P4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chordc1Q9D1P4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Chordc1Q9D1P4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chordc1Q9D1P4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chordc1Q9D1P4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chordc1Q9D1P4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chordc1Q9D1P4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chordc1Q9D1P4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms