Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syf2Q9D198 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syf2Q9D198 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syf2Q9D198 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syf2Q9D198 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syf2Q9D198 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syf2Q9D198 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syf2Q9D198 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Syf2Q9D198 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Syf2Q9D198 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Syf2Q9D198 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Syf2Q9D198 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Syf2Q9D198 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Syf2Q9D198 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Syf2Q9D198 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Syf2Q9D198 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syf2Q9D198 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syf2Q9D198 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syf2Q9D198 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syf2Q9D198 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syf2Q9D198 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Syf2Q9D198 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syf2Q9D198 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syf2Q9D198 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Syf2Q9D198 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syf2Q9D198 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syf2Q9D198 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syf2Q9D198 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syf2Q9D198 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syf2Q9D198 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syf2Q9D198 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syf2Q9D198 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syf2Q9D198 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syf2Q9D198 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syf2Q9D198 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syf2Q9D198 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syf2Q9D198 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syf2Q9D198 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syf2Q9D198 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syf2Q9D198 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syf2Q9D198 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syf2Q9D198 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syf2Q9D198 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syf2Q9D198 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Syf2Q9D198 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Syf2Q9D198 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Syf2Q9D198 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Syf2Q9D198 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syf2Q9D198 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syf2Q9D198 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syf2Q9D198 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syf2Q9D198 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syf2Q9D198 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syf2Q9D198 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syf2Q9D198 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syf2Q9D198 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syf2Q9D198 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syf2Q9D198 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syf2Q9D198 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syf2Q9D198 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syf2Q9D198 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syf2Q9D198 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syf2Q9D198 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syf2Q9D198 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syf2Q9D198 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syf2Q9D198 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syf2Q9D198 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syf2Q9D198 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Syf2Q9D198 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Syf2Q9D198 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Syf2Q9D198 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syf2Q9D198 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Syf2Q9D198 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syf2Q9D198 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syf2Q9D198 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syf2Q9D198 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syf2Q9D198 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syf2Q9D198 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syf2Q9D198 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syf2Q9D198 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syf2Q9D198 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syf2Q9D198 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syf2Q9D198 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syf2Q9D198 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syf2Q9D198 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syf2Q9D198 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syf2Q9D198 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syf2Q9D198 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Syf2Q9D198 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Syf2Q9D198 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Syf2Q9D198 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Syf2Q9D198 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Syf2Q9D198 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syf2Q9D198 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syf2Q9D198 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syf2Q9D198 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syf2Q9D198 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syf2Q9D198 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syf2Q9D198 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syf2Q9D198 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms