Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MINDY3Q9CV28 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MINDY3Q9CV28 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MINDY3Q9CV28 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MINDY3Q9CV28 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MINDY3Q9CV28 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MINDY3Q9CV28 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MINDY3Q9CV28 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MINDY3Q9CV28 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MINDY3Q9CV28 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MINDY3Q9CV28 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MINDY3Q9CV28 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MINDY3Q9CV28 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MINDY3Q9CV28 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MINDY3Q9CV28 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MINDY3Q9CV28 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MINDY3Q9CV28 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MINDY3Q9CV28 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MINDY3Q9CV28 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MINDY3Q9CV28 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MINDY3Q9CV28 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MINDY3Q9CV28 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MINDY3Q9CV28 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MINDY3Q9CV28 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MINDY3Q9CV28 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MINDY3Q9CV28 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MINDY3Q9CV28 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MINDY3Q9CV28 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MINDY3Q9CV28 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MINDY3Q9CV28 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MINDY3Q9CV28 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MINDY3Q9CV28 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MINDY3Q9CV28 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MINDY3Q9CV28 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MINDY3Q9CV28 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MINDY3Q9CV28 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MINDY3Q9CV28 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MINDY3Q9CV28 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MINDY3Q9CV28 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MINDY3Q9CV28 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MINDY3Q9CV28 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MINDY3Q9CV28 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MINDY3Q9CV28 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MINDY3Q9CV28 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MINDY3Q9CV28 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MINDY3Q9CV28 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MINDY3Q9CV28 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MINDY3Q9CV28 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MINDY3Q9CV28 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MINDY3Q9CV28 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MINDY3Q9CV28 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MINDY3Q9CV28 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MINDY3Q9CV28 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MINDY3Q9CV28 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MINDY3Q9CV28 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MINDY3Q9CV28 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MINDY3Q9CV28 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MINDY3Q9CV28 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MINDY3Q9CV28 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MINDY3Q9CV28 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MINDY3Q9CV28 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MINDY3Q9CV28 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MINDY3Q9CV28 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MINDY3Q9CV28 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MINDY3Q9CV28 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MINDY3Q9CV28 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MINDY3Q9CV28 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MINDY3Q9CV28 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MINDY3Q9CV28 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MINDY3Q9CV28 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MINDY3Q9CV28 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MINDY3Q9CV28 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MINDY3Q9CV28 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MINDY3Q9CV28 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MINDY3Q9CV28 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MINDY3Q9CV28 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MINDY3Q9CV28 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MINDY3Q9CV28 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MINDY3Q9CV28 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MINDY3Q9CV28 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MINDY3Q9CV28 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MINDY3Q9CV28 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MINDY3Q9CV28 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MINDY3Q9CV28 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MINDY3Q9CV28 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MINDY3Q9CV28 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MINDY3Q9CV28 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MINDY3Q9CV28 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MINDY3Q9CV28 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MINDY3Q9CV28 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MINDY3Q9CV28 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MINDY3Q9CV28 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MINDY3Q9CV28 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MINDY3Q9CV28 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MINDY3Q9CV28 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MINDY3Q9CV28 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MINDY3Q9CV28 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MINDY3Q9CV28 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MINDY3Q9CV28 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MINDY3Q9CV28 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms