Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930524J08RikQ9CUJ5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930524J08RikQ9CUJ5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930524J08RikQ9CUJ5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930524J08RikQ9CUJ5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930524J08RikQ9CUJ5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930524J08RikQ9CUJ5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930524J08RikQ9CUJ5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930524J08RikQ9CUJ5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930524J08RikQ9CUJ5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930524J08RikQ9CUJ5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930524J08RikQ9CUJ5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930524J08RikQ9CUJ5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930524J08RikQ9CUJ5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930524J08RikQ9CUJ5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930524J08RikQ9CUJ5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930524J08RikQ9CUJ5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930524J08RikQ9CUJ5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930524J08RikQ9CUJ5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930524J08RikQ9CUJ5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930524J08RikQ9CUJ5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930524J08RikQ9CUJ5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930524J08RikQ9CUJ5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930524J08RikQ9CUJ5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930524J08RikQ9CUJ5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930524J08RikQ9CUJ5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930524J08RikQ9CUJ5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930524J08RikQ9CUJ5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930524J08RikQ9CUJ5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930524J08RikQ9CUJ5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms