Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sft2d3Q9CSV6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sft2d3Q9CSV6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sft2d3Q9CSV6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sft2d3Q9CSV6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sft2d3Q9CSV6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sft2d3Q9CSV6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sft2d3Q9CSV6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sft2d3Q9CSV6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sft2d3Q9CSV6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sft2d3Q9CSV6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sft2d3Q9CSV6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sft2d3Q9CSV6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sft2d3Q9CSV6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sft2d3Q9CSV6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sft2d3Q9CSV6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sft2d3Q9CSV6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sft2d3Q9CSV6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sft2d3Q9CSV6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sft2d3Q9CSV6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sft2d3Q9CSV6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sft2d3Q9CSV6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sft2d3Q9CSV6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sft2d3Q9CSV6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sft2d3Q9CSV6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sft2d3Q9CSV6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sft2d3Q9CSV6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sft2d3Q9CSV6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sft2d3Q9CSV6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sft2d3Q9CSV6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sft2d3Q9CSV6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sft2d3Q9CSV6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sft2d3Q9CSV6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sft2d3Q9CSV6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sft2d3Q9CSV6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sft2d3Q9CSV6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sft2d3Q9CSV6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sft2d3Q9CSV6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sft2d3Q9CSV6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sft2d3Q9CSV6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sft2d3Q9CSV6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sft2d3Q9CSV6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sft2d3Q9CSV6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sft2d3Q9CSV6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sft2d3Q9CSV6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sft2d3Q9CSV6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sft2d3Q9CSV6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sft2d3Q9CSV6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sft2d3Q9CSV6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sft2d3Q9CSV6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sft2d3Q9CSV6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sft2d3Q9CSV6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sft2d3Q9CSV6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sft2d3Q9CSV6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sft2d3Q9CSV6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sft2d3Q9CSV6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sft2d3Q9CSV6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sft2d3Q9CSV6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sft2d3Q9CSV6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sft2d3Q9CSV6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sft2d3Q9CSV6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sft2d3Q9CSV6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sft2d3Q9CSV6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sft2d3Q9CSV6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sft2d3Q9CSV6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sft2d3Q9CSV6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sft2d3Q9CSV6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sft2d3Q9CSV6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sft2d3Q9CSV6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sft2d3Q9CSV6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sft2d3Q9CSV6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sft2d3Q9CSV6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sft2d3Q9CSV6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sft2d3Q9CSV6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sft2d3Q9CSV6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sft2d3Q9CSV6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sft2d3Q9CSV6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sft2d3Q9CSV6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sft2d3Q9CSV6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sft2d3Q9CSV6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sft2d3Q9CSV6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sft2d3Q9CSV6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sft2d3Q9CSV6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sft2d3Q9CSV6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sft2d3Q9CSV6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sft2d3Q9CSV6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sft2d3Q9CSV6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sft2d3Q9CSV6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sft2d3Q9CSV6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sft2d3Q9CSV6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sft2d3Q9CSV6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sft2d3Q9CSV6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sft2d3Q9CSV6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Sft2d3Q9CSV6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sft2d3Q9CSV6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sft2d3Q9CSV6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sft2d3Q9CSV6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sft2d3Q9CSV6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sft2d3Q9CSV6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms