Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc96Q9CR92 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc96Q9CR92 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc96Q9CR92 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc96Q9CR92 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc96Q9CR92 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc96Q9CR92 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc96Q9CR92 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc96Q9CR92 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc96Q9CR92 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc96Q9CR92 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc96Q9CR92 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc96Q9CR92 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc96Q9CR92 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc96Q9CR92 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc96Q9CR92 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc96Q9CR92 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc96Q9CR92 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc96Q9CR92 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc96Q9CR92 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc96Q9CR92 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc96Q9CR92 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc96Q9CR92 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc96Q9CR92 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc96Q9CR92 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc96Q9CR92 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc96Q9CR92 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc96Q9CR92 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc96Q9CR92 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc96Q9CR92 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc96Q9CR92 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc96Q9CR92 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc96Q9CR92 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc96Q9CR92 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc96Q9CR92 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc96Q9CR92 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc96Q9CR92 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc96Q9CR92 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc96Q9CR92 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc96Q9CR92 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc96Q9CR92 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc96Q9CR92 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc96Q9CR92 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc96Q9CR92 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc96Q9CR92 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc96Q9CR92 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc96Q9CR92 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc96Q9CR92 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc96Q9CR92 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc96Q9CR92 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc96Q9CR92 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc96Q9CR92 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc96Q9CR92 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc96Q9CR92 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc96Q9CR92 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc96Q9CR92 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc96Q9CR92 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc96Q9CR92 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc96Q9CR92 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc96Q9CR92 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc96Q9CR92 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc96Q9CR92 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc96Q9CR92 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc96Q9CR92 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc96Q9CR92 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc96Q9CR92 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc96Q9CR92 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc96Q9CR92 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc96Q9CR92 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc96Q9CR92 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc96Q9CR92 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc96Q9CR92 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc96Q9CR92 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc96Q9CR92 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc96Q9CR92 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc96Q9CR92 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc96Q9CR92 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc96Q9CR92 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc96Q9CR92 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc96Q9CR92 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc96Q9CR92 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc96Q9CR92 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc96Q9CR92 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc96Q9CR92 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc96Q9CR92 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc96Q9CR92 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc96Q9CR92 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc96Q9CR92 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc96Q9CR92 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc96Q9CR92 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc96Q9CR92 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc96Q9CR92 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc96Q9CR92 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc96Q9CR92 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc96Q9CR92 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc96Q9CR92 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc96Q9CR92 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc96Q9CR92 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc96Q9CR92 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc96Q9CR92 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms