Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR42

Ankrd1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd1Q9CR42 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ankrd1Q9CR42 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ankrd1Q9CR42 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ankrd1Q9CR42 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ankrd1Q9CR42 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ankrd1Q9CR42 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ankrd1Q9CR42 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ankrd1Q9CR42 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ankrd1Q9CR42 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ankrd1Q9CR42 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ankrd1Q9CR42 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ankrd1Q9CR42 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ankrd1Q9CR42 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ankrd1Q9CR42 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ankrd1Q9CR42 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ankrd1Q9CR42 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ankrd1Q9CR42 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ankrd1Q9CR42 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ankrd1Q9CR42 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ankrd1Q9CR42 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ankrd1Q9CR42 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ankrd1Q9CR42 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ankrd1Q9CR42 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ankrd1Q9CR42 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ankrd1Q9CR42 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ankrd1Q9CR42 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ankrd1Q9CR42 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ankrd1Q9CR42 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ankrd1Q9CR42 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ankrd1Q9CR42 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ankrd1Q9CR42 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms