Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX6

Gm16286, MCG141091, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16286Q9CQX6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm16286Q9CQX6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm16286Q9CQX6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm16286Q9CQX6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm16286Q9CQX6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm16286Q9CQX6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm16286Q9CQX6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm16286Q9CQX6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm16286Q9CQX6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm16286Q9CQX6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm16286Q9CQX6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm16286Q9CQX6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm16286Q9CQX6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm16286Q9CQX6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm16286Q9CQX6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm16286Q9CQX6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm16286Q9CQX6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm16286Q9CQX6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm16286Q9CQX6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm16286Q9CQX6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm16286Q9CQX6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm16286Q9CQX6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm16286Q9CQX6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm16286Q9CQX6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm16286Q9CQX6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm16286Q9CQX6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm16286Q9CQX6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm16286Q9CQX6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm16286Q9CQX6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm16286Q9CQX6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm16286Q9CQX6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm16286Q9CQX6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm16286Q9CQX6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm16286Q9CQX6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm16286Q9CQX6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm16286Q9CQX6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm16286Q9CQX6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm16286Q9CQX6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm16286Q9CQX6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm16286Q9CQX6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm16286Q9CQX6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm16286Q9CQX6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm16286Q9CQX6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm16286Q9CQX6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm16286Q9CQX6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm16286Q9CQX6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm16286Q9CQX6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm16286Q9CQX6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm16286Q9CQX6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm16286Q9CQX6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm16286Q9CQX6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm16286Q9CQX6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm16286Q9CQX6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm16286Q9CQX6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm16286Q9CQX6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm16286Q9CQX6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm16286Q9CQX6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm16286Q9CQX6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm16286Q9CQX6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm16286Q9CQX6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm16286Q9CQX6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm16286Q9CQX6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm16286Q9CQX6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm16286Q9CQX6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm16286Q9CQX6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm16286Q9CQX6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm16286Q9CQX6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm16286Q9CQX6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm16286Q9CQX6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm16286Q9CQX6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm16286Q9CQX6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm16286Q9CQX6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm16286Q9CQX6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm16286Q9CQX6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm16286Q9CQX6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm16286Q9CQX6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm16286Q9CQX6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm16286Q9CQX6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm16286Q9CQX6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm16286Q9CQX6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm16286Q9CQX6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm16286Q9CQX6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm16286Q9CQX6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm16286Q9CQX6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm16286Q9CQX6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm16286Q9CQX6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm16286Q9CQX6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm16286Q9CQX6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm16286Q9CQX6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm16286Q9CQX6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm16286Q9CQX6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm16286Q9CQX6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm16286Q9CQX6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm16286Q9CQX6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm16286Q9CQX6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm16286Q9CQX6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm16286Q9CQX6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm16286Q9CQX6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm16286Q9CQX6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm16286Q9CQX6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms