Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PclafQ9CQX4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PclafQ9CQX4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PclafQ9CQX4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PclafQ9CQX4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PclafQ9CQX4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PclafQ9CQX4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PclafQ9CQX4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PclafQ9CQX4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PclafQ9CQX4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PclafQ9CQX4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PclafQ9CQX4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PclafQ9CQX4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PclafQ9CQX4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PclafQ9CQX4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PclafQ9CQX4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PclafQ9CQX4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PclafQ9CQX4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PclafQ9CQX4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PclafQ9CQX4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PclafQ9CQX4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PclafQ9CQX4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PclafQ9CQX4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PclafQ9CQX4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PclafQ9CQX4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PclafQ9CQX4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PclafQ9CQX4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PclafQ9CQX4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PclafQ9CQX4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PclafQ9CQX4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PclafQ9CQX4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PclafQ9CQX4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PclafQ9CQX4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PclafQ9CQX4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PclafQ9CQX4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PclafQ9CQX4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PclafQ9CQX4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PclafQ9CQX4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PclafQ9CQX4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PclafQ9CQX4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PclafQ9CQX4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PclafQ9CQX4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PclafQ9CQX4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PclafQ9CQX4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PclafQ9CQX4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PclafQ9CQX4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PclafQ9CQX4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PclafQ9CQX4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PclafQ9CQX4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PclafQ9CQX4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PclafQ9CQX4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PclafQ9CQX4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PclafQ9CQX4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PclafQ9CQX4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PclafQ9CQX4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PclafQ9CQX4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PclafQ9CQX4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PclafQ9CQX4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PclafQ9CQX4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PclafQ9CQX4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PclafQ9CQX4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PclafQ9CQX4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PclafQ9CQX4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PclafQ9CQX4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PclafQ9CQX4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PclafQ9CQX4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PclafQ9CQX4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PclafQ9CQX4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PclafQ9CQX4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PclafQ9CQX4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PclafQ9CQX4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PclafQ9CQX4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PclafQ9CQX4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PclafQ9CQX4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PclafQ9CQX4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PclafQ9CQX4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PclafQ9CQX4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PclafQ9CQX4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PclafQ9CQX4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PclafQ9CQX4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PclafQ9CQX4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PclafQ9CQX4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PclafQ9CQX4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PclafQ9CQX4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PclafQ9CQX4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PclafQ9CQX4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PclafQ9CQX4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PclafQ9CQX4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PclafQ9CQX4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PclafQ9CQX4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PclafQ9CQX4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PclafQ9CQX4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PclafQ9CQX4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PclafQ9CQX4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PclafQ9CQX4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PclafQ9CQX4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PclafQ9CQX4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PclafQ9CQX4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PclafQ9CQX4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PclafQ9CQX4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms