Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab5aQ9CQD1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab5aQ9CQD1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab5aQ9CQD1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab5aQ9CQD1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab5aQ9CQD1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab5aQ9CQD1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab5aQ9CQD1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab5aQ9CQD1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab5aQ9CQD1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab5aQ9CQD1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab5aQ9CQD1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab5aQ9CQD1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab5aQ9CQD1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab5aQ9CQD1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rab5aQ9CQD1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab5aQ9CQD1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab5aQ9CQD1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab5aQ9CQD1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab5aQ9CQD1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab5aQ9CQD1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab5aQ9CQD1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab5aQ9CQD1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab5aQ9CQD1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab5aQ9CQD1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab5aQ9CQD1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab5aQ9CQD1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab5aQ9CQD1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab5aQ9CQD1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab5aQ9CQD1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rab5aQ9CQD1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rab5aQ9CQD1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rab5aQ9CQD1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rab5aQ9CQD1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab5aQ9CQD1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab5aQ9CQD1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab5aQ9CQD1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab5aQ9CQD1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab5aQ9CQD1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab5aQ9CQD1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab5aQ9CQD1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab5aQ9CQD1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab5aQ9CQD1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab5aQ9CQD1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rab5aQ9CQD1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rab5aQ9CQD1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rab5aQ9CQD1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rab5aQ9CQD1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab5aQ9CQD1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab5aQ9CQD1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab5aQ9CQD1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab5aQ9CQD1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab5aQ9CQD1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab5aQ9CQD1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab5aQ9CQD1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab5aQ9CQD1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab5aQ9CQD1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab5aQ9CQD1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab5aQ9CQD1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rab5aQ9CQD1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rab5aQ9CQD1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab5aQ9CQD1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab5aQ9CQD1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab5aQ9CQD1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab5aQ9CQD1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab5aQ9CQD1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab5aQ9CQD1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab5aQ9CQD1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab5aQ9CQD1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab5aQ9CQD1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab5aQ9CQD1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab5aQ9CQD1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab5aQ9CQD1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab5aQ9CQD1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab5aQ9CQD1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab5aQ9CQD1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab5aQ9CQD1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab5aQ9CQD1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab5aQ9CQD1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab5aQ9CQD1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab5aQ9CQD1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab5aQ9CQD1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab5aQ9CQD1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab5aQ9CQD1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab5aQ9CQD1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab5aQ9CQD1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab5aQ9CQD1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab5aQ9CQD1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms