Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC4

Tmem216, Transmembrane protein 216, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem216Q9CQC4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem216Q9CQC4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem216Q9CQC4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem216Q9CQC4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem216Q9CQC4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem216Q9CQC4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem216Q9CQC4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem216Q9CQC4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem216Q9CQC4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem216Q9CQC4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem216Q9CQC4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem216Q9CQC4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem216Q9CQC4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem216Q9CQC4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem216Q9CQC4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem216Q9CQC4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem216Q9CQC4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem216Q9CQC4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem216Q9CQC4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem216Q9CQC4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem216Q9CQC4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem216Q9CQC4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem216Q9CQC4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem216Q9CQC4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem216Q9CQC4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem216Q9CQC4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem216Q9CQC4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem216Q9CQC4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem216Q9CQC4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmem216Q9CQC4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem216Q9CQC4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem216Q9CQC4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem216Q9CQC4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem216Q9CQC4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem216Q9CQC4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem216Q9CQC4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem216Q9CQC4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem216Q9CQC4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem216Q9CQC4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem216Q9CQC4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem216Q9CQC4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem216Q9CQC4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem216Q9CQC4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem216Q9CQC4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem216Q9CQC4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem216Q9CQC4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem216Q9CQC4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem216Q9CQC4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem216Q9CQC4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem216Q9CQC4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem216Q9CQC4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem216Q9CQC4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem216Q9CQC4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem216Q9CQC4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem216Q9CQC4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem216Q9CQC4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem216Q9CQC4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem216Q9CQC4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem216Q9CQC4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem216Q9CQC4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem216Q9CQC4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem216Q9CQC4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem216Q9CQC4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem216Q9CQC4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmem216Q9CQC4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem216Q9CQC4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem216Q9CQC4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem216Q9CQC4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem216Q9CQC4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem216Q9CQC4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem216Q9CQC4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem216Q9CQC4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem216Q9CQC4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem216Q9CQC4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem216Q9CQC4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem216Q9CQC4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem216Q9CQC4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem216Q9CQC4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem216Q9CQC4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem216Q9CQC4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem216Q9CQC4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem216Q9CQC4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem216Q9CQC4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem216Q9CQC4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem216Q9CQC4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem216Q9CQC4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem216Q9CQC4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem216Q9CQC4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem216Q9CQC4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem216Q9CQC4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem216Q9CQC4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem216Q9CQC4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem216Q9CQC4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem216Q9CQC4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tmem216Q9CQC4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem216Q9CQC4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem216Q9CQC4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem216Q9CQC4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem216Q9CQC4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem216Q9CQC4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms