Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chmp3Q9CQ10 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chmp3Q9CQ10 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chmp3Q9CQ10 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Chmp3Q9CQ10 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Chmp3Q9CQ10 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Chmp3Q9CQ10 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Chmp3Q9CQ10 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Chmp3Q9CQ10 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Chmp3Q9CQ10 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Chmp3Q9CQ10 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Chmp3Q9CQ10 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Chmp3Q9CQ10 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Chmp3Q9CQ10 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Chmp3Q9CQ10 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Chmp3Q9CQ10 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Chmp3Q9CQ10 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Chmp3Q9CQ10 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Chmp3Q9CQ10 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chmp3Q9CQ10 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chmp3Q9CQ10 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Chmp3Q9CQ10 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Chmp3Q9CQ10 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Chmp3Q9CQ10 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Chmp3Q9CQ10 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Chmp3Q9CQ10 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Chmp3Q9CQ10 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Chmp3Q9CQ10 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Chmp3Q9CQ10 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Chmp3Q9CQ10 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Chmp3Q9CQ10 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Chmp3Q9CQ10 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chmp3Q9CQ10 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Chmp3Q9CQ10 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chmp3Q9CQ10 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Chmp3Q9CQ10 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Chmp3Q9CQ10 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chmp3Q9CQ10 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chmp3Q9CQ10 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chmp3Q9CQ10 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chmp3Q9CQ10 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chmp3Q9CQ10 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Chmp3Q9CQ10 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Chmp3Q9CQ10 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chmp3Q9CQ10 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Chmp3Q9CQ10 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Chmp3Q9CQ10 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Chmp3Q9CQ10 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Chmp3Q9CQ10 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Chmp3Q9CQ10 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Chmp3Q9CQ10 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chmp3Q9CQ10 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chmp3Q9CQ10 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chmp3Q9CQ10 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Chmp3Q9CQ10 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Chmp3Q9CQ10 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Chmp3Q9CQ10 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Chmp3Q9CQ10 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Chmp3Q9CQ10 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Chmp3Q9CQ10 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Chmp3Q9CQ10 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Chmp3Q9CQ10 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Chmp3Q9CQ10 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Chmp3Q9CQ10 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Chmp3Q9CQ10 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Chmp3Q9CQ10 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chmp3Q9CQ10 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chmp3Q9CQ10 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
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