Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nsmce3Q9CPR8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nsmce3Q9CPR8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nsmce3Q9CPR8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nsmce3Q9CPR8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsmce3Q9CPR8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsmce3Q9CPR8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsmce3Q9CPR8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsmce3Q9CPR8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsmce3Q9CPR8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsmce3Q9CPR8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsmce3Q9CPR8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nsmce3Q9CPR8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nsmce3Q9CPR8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nsmce3Q9CPR8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nsmce3Q9CPR8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nsmce3Q9CPR8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nsmce3Q9CPR8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nsmce3Q9CPR8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nsmce3Q9CPR8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nsmce3Q9CPR8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nsmce3Q9CPR8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nsmce3Q9CPR8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nsmce3Q9CPR8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nsmce3Q9CPR8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nsmce3Q9CPR8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nsmce3Q9CPR8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nsmce3Q9CPR8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nsmce3Q9CPR8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nsmce3Q9CPR8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nsmce3Q9CPR8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nsmce3Q9CPR8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nsmce3Q9CPR8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nsmce3Q9CPR8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nsmce3Q9CPR8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nsmce3Q9CPR8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nsmce3Q9CPR8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nsmce3Q9CPR8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nsmce3Q9CPR8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nsmce3Q9CPR8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nsmce3Q9CPR8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nsmce3Q9CPR8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nsmce3Q9CPR8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nsmce3Q9CPR8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nsmce3Q9CPR8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nsmce3Q9CPR8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nsmce3Q9CPR8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nsmce3Q9CPR8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nsmce3Q9CPR8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nsmce3Q9CPR8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nsmce3Q9CPR8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nsmce3Q9CPR8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nsmce3Q9CPR8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nsmce3Q9CPR8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nsmce3Q9CPR8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nsmce3Q9CPR8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nsmce3Q9CPR8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nsmce3Q9CPR8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nsmce3Q9CPR8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nsmce3Q9CPR8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nsmce3Q9CPR8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nsmce3Q9CPR8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nsmce3Q9CPR8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nsmce3Q9CPR8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nsmce3Q9CPR8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nsmce3Q9CPR8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nsmce3Q9CPR8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nsmce3Q9CPR8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nsmce3Q9CPR8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nsmce3Q9CPR8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nsmce3Q9CPR8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nsmce3Q9CPR8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nsmce3Q9CPR8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nsmce3Q9CPR8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nsmce3Q9CPR8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nsmce3Q9CPR8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nsmce3Q9CPR8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nsmce3Q9CPR8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nsmce3Q9CPR8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nsmce3Q9CPR8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nsmce3Q9CPR8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nsmce3Q9CPR8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nsmce3Q9CPR8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nsmce3Q9CPR8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nsmce3Q9CPR8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nsmce3Q9CPR8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nsmce3Q9CPR8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nsmce3Q9CPR8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nsmce3Q9CPR8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nsmce3Q9CPR8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nsmce3Q9CPR8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nsmce3Q9CPR8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nsmce3Q9CPR8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nsmce3Q9CPR8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nsmce3Q9CPR8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nsmce3Q9CPR8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nsmce3Q9CPR8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms