Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-4Q9BYQ2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-4Q9BYQ2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-4Q9BYQ2 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC011753.2-201ENST00000425576 610 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007494.2-201ENST00000563757 764 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-4Q9BYQ2 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-4Q9BYQ2 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL162385.1-201ENST00000451595 1202 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-4Q9BYQ2 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-4Q9BYQ2 MT1L-201ENST00000565768 411 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-4Q9BYQ2 WWOX-AS1-201ENST00000567099 443 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC012181.2-201ENST00000570210 699 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-4Q9BYQ2 UCHL3-206ENST00000618773 1050 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP9-4Q9BYQ2 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP9-4Q9BYQ2 SUGT1P3-205ENST00000633814 572 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02057-201ENST00000503882 640 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 CSNK1A1-209ENST00000606299 1075 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 IFNA16-201ENST00000380216 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 LYRM7-203ENST00000510516 604 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC097376.1-201ENST00000602907 997 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005066.1-201ENST00000613582 1007 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 FGA-203ENST00000622532 1130 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 MCEE-201ENST00000244217 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00571-201ENST00000434565 521 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 RABGGTB-201ENST00000319942 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 TBCA-202ENST00000380377 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 MEF2C-AS1-206ENST00000511100 828 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 GIMAP7-201ENST00000313543 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNMB3-201ENST00000314235 1485 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP001020.1-201ENST00000579595 464 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS26-201ENST00000356464 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADAM20P2-201ENST00000515830 1273 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 BX255923.1-201ENST00000613309 681 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC116348.1-201ENST00000562525 528 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.2 ms