Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubxn6Q99PL6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ubxn6Q99PL6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubxn6Q99PL6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn6Q99PL6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn6Q99PL6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn6Q99PL6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubxn6Q99PL6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubxn6Q99PL6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubxn6Q99PL6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubxn6Q99PL6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubxn6Q99PL6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubxn6Q99PL6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubxn6Q99PL6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubxn6Q99PL6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubxn6Q99PL6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn6Q99PL6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn6Q99PL6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn6Q99PL6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn6Q99PL6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn6Q99PL6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn6Q99PL6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn6Q99PL6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn6Q99PL6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn6Q99PL6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ubxn6Q99PL6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn6Q99PL6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn6Q99PL6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn6Q99PL6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn6Q99PL6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn6Q99PL6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn6Q99PL6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn6Q99PL6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubxn6Q99PL6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ubxn6Q99PL6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubxn6Q99PL6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubxn6Q99PL6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubxn6Q99PL6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubxn6Q99PL6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubxn6Q99PL6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn6Q99PL6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn6Q99PL6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn6Q99PL6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn6Q99PL6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn6Q99PL6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn6Q99PL6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn6Q99PL6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn6Q99PL6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn6Q99PL6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn6Q99PL6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn6Q99PL6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubxn6Q99PL6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubxn6Q99PL6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubxn6Q99PL6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubxn6Q99PL6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubxn6Q99PL6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ubxn6Q99PL6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ubxn6Q99PL6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ubxn6Q99PL6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ubxn6Q99PL6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubxn6Q99PL6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubxn6Q99PL6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubxn6Q99PL6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn6Q99PL6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn6Q99PL6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn6Q99PL6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn6Q99PL6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn6Q99PL6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn6Q99PL6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubxn6Q99PL6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ubxn6Q99PL6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ubxn6Q99PL6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubxn6Q99PL6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubxn6Q99PL6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubxn6Q99PL6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubxn6Q99PL6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubxn6Q99PL6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubxn6Q99PL6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubxn6Q99PL6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubxn6Q99PL6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubxn6Q99PL6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubxn6Q99PL6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn6Q99PL6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn6Q99PL6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn6Q99PL6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn6Q99PL6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn6Q99PL6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn6Q99PL6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ubxn6Q99PL6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ubxn6Q99PL6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ubxn6Q99PL6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ubxn6Q99PL6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ubxn6Q99PL6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ubxn6Q99PL6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ubxn6Q99PL6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ubxn6Q99PL6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ubxn6Q99PL6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ubxn6Q99PL6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ubxn6Q99PL6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ubxn6Q99PL6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms