Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE9

Arl4d, ADP-ribosylation factor-like protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl4dQ99PE9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arl4dQ99PE9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arl4dQ99PE9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arl4dQ99PE9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arl4dQ99PE9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arl4dQ99PE9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arl4dQ99PE9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arl4dQ99PE9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Arl4dQ99PE9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arl4dQ99PE9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arl4dQ99PE9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arl4dQ99PE9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arl4dQ99PE9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arl4dQ99PE9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arl4dQ99PE9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arl4dQ99PE9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arl4dQ99PE9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arl4dQ99PE9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arl4dQ99PE9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arl4dQ99PE9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arl4dQ99PE9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arl4dQ99PE9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arl4dQ99PE9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arl4dQ99PE9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arl4dQ99PE9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arl4dQ99PE9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arl4dQ99PE9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arl4dQ99PE9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arl4dQ99PE9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arl4dQ99PE9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arl4dQ99PE9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arl4dQ99PE9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arl4dQ99PE9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arl4dQ99PE9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arl4dQ99PE9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arl4dQ99PE9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arl4dQ99PE9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arl4dQ99PE9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arl4dQ99PE9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arl4dQ99PE9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arl4dQ99PE9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arl4dQ99PE9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arl4dQ99PE9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arl4dQ99PE9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arl4dQ99PE9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arl4dQ99PE9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arl4dQ99PE9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arl4dQ99PE9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arl4dQ99PE9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arl4dQ99PE9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arl4dQ99PE9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arl4dQ99PE9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arl4dQ99PE9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arl4dQ99PE9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arl4dQ99PE9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arl4dQ99PE9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arl4dQ99PE9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arl4dQ99PE9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arl4dQ99PE9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arl4dQ99PE9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arl4dQ99PE9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arl4dQ99PE9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arl4dQ99PE9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arl4dQ99PE9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arl4dQ99PE9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arl4dQ99PE9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arl4dQ99PE9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Arl4dQ99PE9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arl4dQ99PE9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Arl4dQ99PE9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl4dQ99PE9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl4dQ99PE9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl4dQ99PE9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl4dQ99PE9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl4dQ99PE9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl4dQ99PE9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl4dQ99PE9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl4dQ99PE9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl4dQ99PE9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl4dQ99PE9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl4dQ99PE9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl4dQ99PE9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl4dQ99PE9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl4dQ99PE9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl4dQ99PE9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl4dQ99PE9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl4dQ99PE9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arl4dQ99PE9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arl4dQ99PE9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arl4dQ99PE9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arl4dQ99PE9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arl4dQ99PE9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arl4dQ99PE9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arl4dQ99PE9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arl4dQ99PE9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arl4dQ99PE9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arl4dQ99PE9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arl4dQ99PE9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arl4dQ99PE9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arl4dQ99PE9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms