Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ms4a4dQ99N05 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ms4a4dQ99N05 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ms4a4dQ99N05 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ms4a4dQ99N05 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ms4a4dQ99N05 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ms4a4dQ99N05 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ms4a4dQ99N05 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ms4a4dQ99N05 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a4dQ99N05 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a4dQ99N05 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a4dQ99N05 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a4dQ99N05 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a4dQ99N05 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a4dQ99N05 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a4dQ99N05 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a4dQ99N05 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a4dQ99N05 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a4dQ99N05 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a4dQ99N05 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a4dQ99N05 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a4dQ99N05 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a4dQ99N05 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a4dQ99N05 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ms4a4dQ99N05 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ms4a4dQ99N05 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ms4a4dQ99N05 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Ms4a4dQ99N05 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a4dQ99N05 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a4dQ99N05 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a4dQ99N05 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a4dQ99N05 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a4dQ99N05 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a4dQ99N05 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a4dQ99N05 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a4dQ99N05 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a4dQ99N05 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a4dQ99N05 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a4dQ99N05 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ms4a4dQ99N05 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ms4a4dQ99N05 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ms4a4dQ99N05 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ms4a4dQ99N05 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ms4a4dQ99N05 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ms4a4dQ99N05 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ms4a4dQ99N05 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ms4a4dQ99N05 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ms4a4dQ99N05 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ms4a4dQ99N05 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ms4a4dQ99N05 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ms4a4dQ99N05 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ms4a4dQ99N05 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ms4a4dQ99N05 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ms4a4dQ99N05 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ms4a4dQ99N05 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ms4a4dQ99N05 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ms4a4dQ99N05 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ms4a4dQ99N05 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Ms4a4dQ99N05 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ms4a4dQ99N05 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ms4a4dQ99N05 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ms4a4dQ99N05 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ms4a4dQ99N05 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ms4a4dQ99N05 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ms4a4dQ99N05 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a4dQ99N05 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a4dQ99N05 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a4dQ99N05 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a4dQ99N05 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a4dQ99N05 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a4dQ99N05 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a4dQ99N05 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a4dQ99N05 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a4dQ99N05 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a4dQ99N05 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a4dQ99N05 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ms4a4dQ99N05 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ms4a4dQ99N05 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ms4a4dQ99N05 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a4dQ99N05 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a4dQ99N05 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a4dQ99N05 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a4dQ99N05 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a4dQ99N05 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ms4a4dQ99N05 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ms4a4dQ99N05 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ms4a4dQ99N05 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ms4a4dQ99N05 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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