Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP3

Calcb, Calcitonin gene-related peptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcbQ99MP3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CalcbQ99MP3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CalcbQ99MP3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CalcbQ99MP3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CalcbQ99MP3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CalcbQ99MP3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CalcbQ99MP3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CalcbQ99MP3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CalcbQ99MP3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CalcbQ99MP3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CalcbQ99MP3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CalcbQ99MP3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CalcbQ99MP3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CalcbQ99MP3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CalcbQ99MP3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CalcbQ99MP3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CalcbQ99MP3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CalcbQ99MP3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CalcbQ99MP3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CalcbQ99MP3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CalcbQ99MP3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CalcbQ99MP3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CalcbQ99MP3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CalcbQ99MP3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CalcbQ99MP3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CalcbQ99MP3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CalcbQ99MP3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CalcbQ99MP3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CalcbQ99MP3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CalcbQ99MP3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CalcbQ99MP3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CalcbQ99MP3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CalcbQ99MP3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CalcbQ99MP3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CalcbQ99MP3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CalcbQ99MP3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CalcbQ99MP3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CalcbQ99MP3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CalcbQ99MP3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CalcbQ99MP3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CalcbQ99MP3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CalcbQ99MP3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CalcbQ99MP3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CalcbQ99MP3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CalcbQ99MP3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CalcbQ99MP3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CalcbQ99MP3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CalcbQ99MP3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CalcbQ99MP3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CalcbQ99MP3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CalcbQ99MP3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CalcbQ99MP3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CalcbQ99MP3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CalcbQ99MP3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CalcbQ99MP3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CalcbQ99MP3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CalcbQ99MP3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CalcbQ99MP3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CalcbQ99MP3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CalcbQ99MP3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CalcbQ99MP3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CalcbQ99MP3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CalcbQ99MP3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CalcbQ99MP3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CalcbQ99MP3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CalcbQ99MP3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CalcbQ99MP3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CalcbQ99MP3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CalcbQ99MP3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CalcbQ99MP3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CalcbQ99MP3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CalcbQ99MP3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CalcbQ99MP3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CalcbQ99MP3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CalcbQ99MP3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CalcbQ99MP3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CalcbQ99MP3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CalcbQ99MP3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CalcbQ99MP3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CalcbQ99MP3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CalcbQ99MP3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CalcbQ99MP3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CalcbQ99MP3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CalcbQ99MP3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CalcbQ99MP3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CalcbQ99MP3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CalcbQ99MP3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CalcbQ99MP3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CalcbQ99MP3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CalcbQ99MP3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CalcbQ99MP3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CalcbQ99MP3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CalcbQ99MP3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CalcbQ99MP3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CalcbQ99MP3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CalcbQ99MP3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CalcbQ99MP3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CalcbQ99MP3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CalcbQ99MP3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CalcbQ99MP3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms