Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH5

Nme5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme5Q99MH5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nme5Q99MH5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nme5Q99MH5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nme5Q99MH5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nme5Q99MH5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nme5Q99MH5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nme5Q99MH5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nme5Q99MH5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nme5Q99MH5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nme5Q99MH5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nme5Q99MH5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nme5Q99MH5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nme5Q99MH5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nme5Q99MH5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nme5Q99MH5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nme5Q99MH5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nme5Q99MH5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nme5Q99MH5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nme5Q99MH5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nme5Q99MH5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nme5Q99MH5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nme5Q99MH5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nme5Q99MH5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nme5Q99MH5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nme5Q99MH5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nme5Q99MH5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nme5Q99MH5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nme5Q99MH5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nme5Q99MH5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nme5Q99MH5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nme5Q99MH5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nme5Q99MH5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nme5Q99MH5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nme5Q99MH5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nme5Q99MH5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nme5Q99MH5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nme5Q99MH5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nme5Q99MH5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nme5Q99MH5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nme5Q99MH5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nme5Q99MH5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nme5Q99MH5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nme5Q99MH5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nme5Q99MH5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nme5Q99MH5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nme5Q99MH5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nme5Q99MH5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nme5Q99MH5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nme5Q99MH5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nme5Q99MH5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nme5Q99MH5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nme5Q99MH5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nme5Q99MH5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nme5Q99MH5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nme5Q99MH5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nme5Q99MH5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nme5Q99MH5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nme5Q99MH5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nme5Q99MH5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nme5Q99MH5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nme5Q99MH5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nme5Q99MH5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nme5Q99MH5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nme5Q99MH5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nme5Q99MH5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nme5Q99MH5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nme5Q99MH5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nme5Q99MH5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nme5Q99MH5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nme5Q99MH5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nme5Q99MH5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nme5Q99MH5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nme5Q99MH5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nme5Q99MH5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nme5Q99MH5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nme5Q99MH5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nme5Q99MH5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nme5Q99MH5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nme5Q99MH5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nme5Q99MH5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nme5Q99MH5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nme5Q99MH5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nme5Q99MH5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nme5Q99MH5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nme5Q99MH5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nme5Q99MH5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nme5Q99MH5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nme5Q99MH5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nme5Q99MH5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nme5Q99MH5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nme5Q99MH5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nme5Q99MH5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nme5Q99MH5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nme5Q99MH5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nme5Q99MH5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nme5Q99MH5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nme5Q99MH5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nme5Q99MH5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nme5Q99MH5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nme5Q99MH5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms