Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tm2d1Q99MB3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tm2d1Q99MB3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tm2d1Q99MB3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tm2d1Q99MB3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tm2d1Q99MB3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tm2d1Q99MB3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tm2d1Q99MB3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tm2d1Q99MB3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tm2d1Q99MB3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tm2d1Q99MB3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tm2d1Q99MB3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tm2d1Q99MB3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tm2d1Q99MB3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tm2d1Q99MB3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tm2d1Q99MB3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tm2d1Q99MB3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tm2d1Q99MB3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tm2d1Q99MB3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tm2d1Q99MB3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tm2d1Q99MB3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tm2d1Q99MB3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tm2d1Q99MB3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tm2d1Q99MB3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tm2d1Q99MB3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tm2d1Q99MB3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tm2d1Q99MB3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tm2d1Q99MB3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tm2d1Q99MB3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tm2d1Q99MB3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tm2d1Q99MB3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tm2d1Q99MB3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm2d1Q99MB3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm2d1Q99MB3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm2d1Q99MB3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm2d1Q99MB3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm2d1Q99MB3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm2d1Q99MB3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm2d1Q99MB3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm2d1Q99MB3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm2d1Q99MB3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Tm2d1Q99MB3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm2d1Q99MB3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm2d1Q99MB3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm2d1Q99MB3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm2d1Q99MB3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm2d1Q99MB3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm2d1Q99MB3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm2d1Q99MB3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm2d1Q99MB3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm2d1Q99MB3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm2d1Q99MB3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm2d1Q99MB3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm2d1Q99MB3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm2d1Q99MB3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm2d1Q99MB3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm2d1Q99MB3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm2d1Q99MB3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm2d1Q99MB3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm2d1Q99MB3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm2d1Q99MB3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm2d1Q99MB3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm2d1Q99MB3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm2d1Q99MB3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm2d1Q99MB3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm2d1Q99MB3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm2d1Q99MB3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm2d1Q99MB3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm2d1Q99MB3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm2d1Q99MB3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm2d1Q99MB3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms