Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clcc1Q99LI2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clcc1Q99LI2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clcc1Q99LI2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clcc1Q99LI2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clcc1Q99LI2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clcc1Q99LI2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clcc1Q99LI2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clcc1Q99LI2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clcc1Q99LI2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clcc1Q99LI2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clcc1Q99LI2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clcc1Q99LI2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clcc1Q99LI2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Clcc1Q99LI2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clcc1Q99LI2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clcc1Q99LI2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clcc1Q99LI2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Clcc1Q99LI2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clcc1Q99LI2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clcc1Q99LI2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clcc1Q99LI2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clcc1Q99LI2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clcc1Q99LI2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clcc1Q99LI2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clcc1Q99LI2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clcc1Q99LI2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clcc1Q99LI2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clcc1Q99LI2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clcc1Q99LI2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clcc1Q99LI2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clcc1Q99LI2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clcc1Q99LI2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clcc1Q99LI2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clcc1Q99LI2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clcc1Q99LI2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clcc1Q99LI2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Clcc1Q99LI2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Clcc1Q99LI2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clcc1Q99LI2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clcc1Q99LI2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcc1Q99LI2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcc1Q99LI2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcc1Q99LI2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcc1Q99LI2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcc1Q99LI2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcc1Q99LI2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcc1Q99LI2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clcc1Q99LI2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clcc1Q99LI2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clcc1Q99LI2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clcc1Q99LI2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clcc1Q99LI2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clcc1Q99LI2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clcc1Q99LI2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clcc1Q99LI2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcc1Q99LI2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcc1Q99LI2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcc1Q99LI2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcc1Q99LI2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcc1Q99LI2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcc1Q99LI2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcc1Q99LI2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcc1Q99LI2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcc1Q99LI2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clcc1Q99LI2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clcc1Q99LI2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clcc1Q99LI2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clcc1Q99LI2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clcc1Q99LI2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clcc1Q99LI2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clcc1Q99LI2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clcc1Q99LI2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clcc1Q99LI2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clcc1Q99LI2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Clcc1Q99LI2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clcc1Q99LI2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcc1Q99LI2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcc1Q99LI2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcc1Q99LI2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcc1Q99LI2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clcc1Q99LI2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clcc1Q99LI2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clcc1Q99LI2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clcc1Q99LI2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Clcc1Q99LI2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcc1Q99LI2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcc1Q99LI2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clcc1Q99LI2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clcc1Q99LI2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clcc1Q99LI2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clcc1Q99LI2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clcc1Q99LI2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clcc1Q99LI2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcc1Q99LI2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clcc1Q99LI2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clcc1Q99LI2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clcc1Q99LI2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms