Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clint1Q99KN9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clint1Q99KN9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clint1Q99KN9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clint1Q99KN9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clint1Q99KN9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Clint1Q99KN9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Clint1Q99KN9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clint1Q99KN9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clint1Q99KN9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Clint1Q99KN9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clint1Q99KN9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clint1Q99KN9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clint1Q99KN9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Clint1Q99KN9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clint1Q99KN9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clint1Q99KN9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clint1Q99KN9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clint1Q99KN9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clint1Q99KN9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clint1Q99KN9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clint1Q99KN9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clint1Q99KN9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clint1Q99KN9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clint1Q99KN9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clint1Q99KN9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clint1Q99KN9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clint1Q99KN9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clint1Q99KN9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clint1Q99KN9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clint1Q99KN9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clint1Q99KN9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clint1Q99KN9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clint1Q99KN9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clint1Q99KN9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clint1Q99KN9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clint1Q99KN9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clint1Q99KN9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clint1Q99KN9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clint1Q99KN9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clint1Q99KN9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clint1Q99KN9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clint1Q99KN9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clint1Q99KN9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clint1Q99KN9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clint1Q99KN9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clint1Q99KN9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clint1Q99KN9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clint1Q99KN9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clint1Q99KN9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clint1Q99KN9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clint1Q99KN9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clint1Q99KN9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clint1Q99KN9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clint1Q99KN9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clint1Q99KN9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Clint1Q99KN9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clint1Q99KN9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clint1Q99KN9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clint1Q99KN9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clint1Q99KN9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clint1Q99KN9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clint1Q99KN9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clint1Q99KN9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Clint1Q99KN9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clint1Q99KN9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clint1Q99KN9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clint1Q99KN9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clint1Q99KN9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clint1Q99KN9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clint1Q99KN9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Clint1Q99KN9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clint1Q99KN9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clint1Q99KN9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clint1Q99KN9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clint1Q99KN9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clint1Q99KN9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clint1Q99KN9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clint1Q99KN9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Clint1Q99KN9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clint1Q99KN9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clint1Q99KN9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clint1Q99KN9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Clint1Q99KN9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Clint1Q99KN9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Clint1Q99KN9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clint1Q99KN9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clint1Q99KN9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clint1Q99KN9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clint1Q99KN9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clint1Q99KN9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clint1Q99KN9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clint1Q99KN9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clint1Q99KN9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Clint1Q99KN9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clint1Q99KN9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clint1Q99KN9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clint1Q99KN9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clint1Q99KN9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clint1Q99KN9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms