Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CsprsQ99388 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CsprsQ99388 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CsprsQ99388 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CsprsQ99388 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CsprsQ99388 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CsprsQ99388 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CsprsQ99388 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CsprsQ99388 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CsprsQ99388 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CsprsQ99388 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CsprsQ99388 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CsprsQ99388 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CsprsQ99388 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CsprsQ99388 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CsprsQ99388 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CsprsQ99388 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CsprsQ99388 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CsprsQ99388 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CsprsQ99388 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CsprsQ99388 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CsprsQ99388 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CsprsQ99388 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CsprsQ99388 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CsprsQ99388 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CsprsQ99388 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CsprsQ99388 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CsprsQ99388 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CsprsQ99388 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CsprsQ99388 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CsprsQ99388 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CsprsQ99388 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CsprsQ99388 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CsprsQ99388 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CsprsQ99388 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CsprsQ99388 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CsprsQ99388 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CsprsQ99388 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CsprsQ99388 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CsprsQ99388 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CsprsQ99388 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CsprsQ99388 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CsprsQ99388 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CsprsQ99388 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CsprsQ99388 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CsprsQ99388 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CsprsQ99388 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CsprsQ99388 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CsprsQ99388 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CsprsQ99388 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CsprsQ99388 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CsprsQ99388 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CsprsQ99388 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CsprsQ99388 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CsprsQ99388 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CsprsQ99388 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CsprsQ99388 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CsprsQ99388 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CsprsQ99388 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CsprsQ99388 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CsprsQ99388 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CsprsQ99388 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CsprsQ99388 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CsprsQ99388 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CsprsQ99388 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CsprsQ99388 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CsprsQ99388 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CsprsQ99388 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CsprsQ99388 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CsprsQ99388 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CsprsQ99388 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CsprsQ99388 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CsprsQ99388 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CsprsQ99388 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CsprsQ99388 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CsprsQ99388 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CsprsQ99388 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CsprsQ99388 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CsprsQ99388 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CsprsQ99388 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CsprsQ99388 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CsprsQ99388 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CsprsQ99388 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CsprsQ99388 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CsprsQ99388 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CsprsQ99388 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CsprsQ99388 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CsprsQ99388 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CsprsQ99388 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CsprsQ99388 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CsprsQ99388 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CsprsQ99388 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CsprsQ99388 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CsprsQ99388 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CsprsQ99388 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CsprsQ99388 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CsprsQ99388 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CsprsQ99388 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CsprsQ99388 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CsprsQ99388 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms