Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf144aQ925F3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf144aQ925F3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf144aQ925F3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf144aQ925F3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf144aQ925F3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf144aQ925F3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf144aQ925F3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf144aQ925F3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf144aQ925F3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf144aQ925F3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf144aQ925F3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf144aQ925F3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf144aQ925F3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf144aQ925F3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf144aQ925F3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf144aQ925F3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf144aQ925F3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf144aQ925F3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf144aQ925F3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf144aQ925F3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf144aQ925F3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf144aQ925F3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf144aQ925F3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf144aQ925F3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf144aQ925F3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf144aQ925F3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf144aQ925F3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf144aQ925F3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf144aQ925F3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf144aQ925F3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf144aQ925F3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf144aQ925F3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf144aQ925F3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf144aQ925F3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf144aQ925F3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf144aQ925F3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf144aQ925F3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf144aQ925F3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf144aQ925F3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf144aQ925F3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf144aQ925F3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf144aQ925F3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf144aQ925F3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf144aQ925F3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf144aQ925F3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf144aQ925F3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf144aQ925F3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf144aQ925F3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf144aQ925F3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf144aQ925F3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf144aQ925F3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf144aQ925F3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf144aQ925F3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf144aQ925F3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf144aQ925F3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf144aQ925F3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnf144aQ925F3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnf144aQ925F3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf144aQ925F3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf144aQ925F3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf144aQ925F3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf144aQ925F3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf144aQ925F3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf144aQ925F3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf144aQ925F3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf144aQ925F3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf144aQ925F3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf144aQ925F3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf144aQ925F3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf144aQ925F3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf144aQ925F3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf144aQ925F3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf144aQ925F3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf144aQ925F3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf144aQ925F3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf144aQ925F3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf144aQ925F3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf144aQ925F3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf144aQ925F3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf144aQ925F3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf144aQ925F3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf144aQ925F3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf144aQ925F3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf144aQ925F3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf144aQ925F3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf144aQ925F3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf144aQ925F3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf144aQ925F3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf144aQ925F3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf144aQ925F3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf144aQ925F3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf144aQ925F3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf144aQ925F3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf144aQ925F3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf144aQ925F3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf144aQ925F3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf144aQ925F3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf144aQ925F3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf144aQ925F3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms