Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Afg3l1Q920A7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Afg3l1Q920A7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Afg3l1Q920A7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Afg3l1Q920A7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Afg3l1Q920A7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Afg3l1Q920A7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Afg3l1Q920A7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Afg3l1Q920A7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Afg3l1Q920A7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Afg3l1Q920A7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Afg3l1Q920A7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Afg3l1Q920A7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Afg3l1Q920A7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Afg3l1Q920A7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Afg3l1Q920A7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Afg3l1Q920A7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Afg3l1Q920A7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Afg3l1Q920A7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Afg3l1Q920A7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Afg3l1Q920A7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Afg3l1Q920A7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Afg3l1Q920A7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Afg3l1Q920A7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Afg3l1Q920A7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Afg3l1Q920A7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Afg3l1Q920A7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Afg3l1Q920A7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Afg3l1Q920A7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Afg3l1Q920A7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Afg3l1Q920A7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Afg3l1Q920A7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Afg3l1Q920A7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Afg3l1Q920A7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Afg3l1Q920A7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Afg3l1Q920A7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Afg3l1Q920A7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Afg3l1Q920A7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Afg3l1Q920A7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Afg3l1Q920A7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Afg3l1Q920A7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Afg3l1Q920A7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Afg3l1Q920A7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Afg3l1Q920A7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Afg3l1Q920A7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Afg3l1Q920A7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Afg3l1Q920A7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Afg3l1Q920A7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Afg3l1Q920A7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Afg3l1Q920A7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Afg3l1Q920A7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Afg3l1Q920A7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Afg3l1Q920A7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Afg3l1Q920A7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Afg3l1Q920A7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Afg3l1Q920A7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Afg3l1Q920A7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Afg3l1Q920A7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Afg3l1Q920A7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Afg3l1Q920A7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Afg3l1Q920A7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Afg3l1Q920A7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Afg3l1Q920A7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Afg3l1Q920A7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Afg3l1Q920A7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Afg3l1Q920A7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Afg3l1Q920A7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Afg3l1Q920A7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Afg3l1Q920A7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Afg3l1Q920A7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Afg3l1Q920A7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Afg3l1Q920A7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Afg3l1Q920A7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Afg3l1Q920A7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Afg3l1Q920A7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Afg3l1Q920A7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Afg3l1Q920A7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Afg3l1Q920A7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Afg3l1Q920A7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Afg3l1Q920A7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Afg3l1Q920A7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Afg3l1Q920A7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Afg3l1Q920A7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Afg3l1Q920A7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Afg3l1Q920A7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Afg3l1Q920A7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Afg3l1Q920A7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Afg3l1Q920A7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Afg3l1Q920A7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Afg3l1Q920A7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Afg3l1Q920A7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Afg3l1Q920A7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Afg3l1Q920A7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Afg3l1Q920A7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Afg3l1Q920A7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Afg3l1Q920A7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Afg3l1Q920A7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Afg3l1Q920A7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Afg3l1Q920A7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Afg3l1Q920A7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.8 ms