Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpe65Q91ZQ5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpe65Q91ZQ5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpe65Q91ZQ5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpe65Q91ZQ5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpe65Q91ZQ5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpe65Q91ZQ5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpe65Q91ZQ5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpe65Q91ZQ5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpe65Q91ZQ5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpe65Q91ZQ5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpe65Q91ZQ5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpe65Q91ZQ5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpe65Q91ZQ5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpe65Q91ZQ5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpe65Q91ZQ5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpe65Q91ZQ5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpe65Q91ZQ5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpe65Q91ZQ5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpe65Q91ZQ5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpe65Q91ZQ5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpe65Q91ZQ5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpe65Q91ZQ5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpe65Q91ZQ5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpe65Q91ZQ5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpe65Q91ZQ5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpe65Q91ZQ5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpe65Q91ZQ5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpe65Q91ZQ5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpe65Q91ZQ5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpe65Q91ZQ5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpe65Q91ZQ5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpe65Q91ZQ5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpe65Q91ZQ5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpe65Q91ZQ5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpe65Q91ZQ5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpe65Q91ZQ5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpe65Q91ZQ5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpe65Q91ZQ5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpe65Q91ZQ5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpe65Q91ZQ5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpe65Q91ZQ5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpe65Q91ZQ5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpe65Q91ZQ5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpe65Q91ZQ5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpe65Q91ZQ5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpe65Q91ZQ5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpe65Q91ZQ5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpe65Q91ZQ5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpe65Q91ZQ5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpe65Q91ZQ5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpe65Q91ZQ5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpe65Q91ZQ5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpe65Q91ZQ5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpe65Q91ZQ5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpe65Q91ZQ5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpe65Q91ZQ5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpe65Q91ZQ5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpe65Q91ZQ5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpe65Q91ZQ5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpe65Q91ZQ5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpe65Q91ZQ5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpe65Q91ZQ5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpe65Q91ZQ5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpe65Q91ZQ5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpe65Q91ZQ5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpe65Q91ZQ5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpe65Q91ZQ5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpe65Q91ZQ5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpe65Q91ZQ5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpe65Q91ZQ5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpe65Q91ZQ5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpe65Q91ZQ5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpe65Q91ZQ5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpe65Q91ZQ5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpe65Q91ZQ5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpe65Q91ZQ5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpe65Q91ZQ5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpe65Q91ZQ5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpe65Q91ZQ5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpe65Q91ZQ5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpe65Q91ZQ5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpe65Q91ZQ5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpe65Q91ZQ5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpe65Q91ZQ5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpe65Q91ZQ5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpe65Q91ZQ5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpe65Q91ZQ5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpe65Q91ZQ5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpe65Q91ZQ5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpe65Q91ZQ5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpe65Q91ZQ5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpe65Q91ZQ5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpe65Q91ZQ5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpe65Q91ZQ5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpe65Q91ZQ5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpe65Q91ZQ5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpe65Q91ZQ5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpe65Q91ZQ5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpe65Q91ZQ5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms