Protein–RNA interactions for Protein: Q91YI1

Atg13, Autophagy-related protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg13Q91YI1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg13Q91YI1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atg13Q91YI1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atg13Q91YI1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atg13Q91YI1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atg13Q91YI1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg13Q91YI1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg13Q91YI1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg13Q91YI1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg13Q91YI1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atg13Q91YI1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atg13Q91YI1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atg13Q91YI1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atg13Q91YI1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atg13Q91YI1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Atg13Q91YI1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atg13Q91YI1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg13Q91YI1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg13Q91YI1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg13Q91YI1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atg13Q91YI1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Atg13Q91YI1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atg13Q91YI1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg13Q91YI1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg13Q91YI1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg13Q91YI1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg13Q91YI1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg13Q91YI1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg13Q91YI1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg13Q91YI1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg13Q91YI1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg13Q91YI1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg13Q91YI1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg13Q91YI1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg13Q91YI1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg13Q91YI1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg13Q91YI1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg13Q91YI1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg13Q91YI1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg13Q91YI1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg13Q91YI1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg13Q91YI1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg13Q91YI1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atg13Q91YI1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg13Q91YI1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg13Q91YI1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg13Q91YI1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg13Q91YI1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg13Q91YI1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg13Q91YI1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg13Q91YI1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg13Q91YI1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg13Q91YI1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atg13Q91YI1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atg13Q91YI1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atg13Q91YI1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atg13Q91YI1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg13Q91YI1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg13Q91YI1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg13Q91YI1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg13Q91YI1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg13Q91YI1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg13Q91YI1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg13Q91YI1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg13Q91YI1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg13Q91YI1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg13Q91YI1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg13Q91YI1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg13Q91YI1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atg13Q91YI1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atg13Q91YI1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Atg13Q91YI1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atg13Q91YI1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atg13Q91YI1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg13Q91YI1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg13Q91YI1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg13Q91YI1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atg13Q91YI1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atg13Q91YI1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atg13Q91YI1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atg13Q91YI1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atg13Q91YI1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atg13Q91YI1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg13Q91YI1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg13Q91YI1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg13Q91YI1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg13Q91YI1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg13Q91YI1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atg13Q91YI1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atg13Q91YI1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atg13Q91YI1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atg13Q91YI1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atg13Q91YI1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atg13Q91YI1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atg13Q91YI1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atg13Q91YI1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Atg13Q91YI1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atg13Q91YI1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atg13Q91YI1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atg13Q91YI1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms