Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Hps3Q91VB4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hps3Q91VB4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hps3Q91VB4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hps3Q91VB4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hps3Q91VB4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hps3Q91VB4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hps3Q91VB4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hps3Q91VB4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Hps3Q91VB4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Hps3Q91VB4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hps3Q91VB4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hps3Q91VB4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hps3Q91VB4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hps3Q91VB4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hps3Q91VB4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hps3Q91VB4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hps3Q91VB4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hps3Q91VB4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hps3Q91VB4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hps3Q91VB4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hps3Q91VB4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hps3Q91VB4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hps3Q91VB4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hps3Q91VB4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hps3Q91VB4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Hps3Q91VB4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hps3Q91VB4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Hps3Q91VB4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hps3Q91VB4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hps3Q91VB4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hps3Q91VB4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hps3Q91VB4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Hps3Q91VB4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hps3Q91VB4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hps3Q91VB4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hps3Q91VB4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hps3Q91VB4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hps3Q91VB4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hps3Q91VB4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hps3Q91VB4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hps3Q91VB4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hps3Q91VB4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hps3Q91VB4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Hps3Q91VB4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hps3Q91VB4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hps3Q91VB4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hps3Q91VB4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hps3Q91VB4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hps3Q91VB4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hps3Q91VB4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hps3Q91VB4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hps3Q91VB4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hps3Q91VB4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hps3Q91VB4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Hps3Q91VB4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Hps3Q91VB4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hps3Q91VB4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hps3Q91VB4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hps3Q91VB4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hps3Q91VB4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Hps3Q91VB4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hps3Q91VB4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hps3Q91VB4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hps3Q91VB4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hps3Q91VB4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hps3Q91VB4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hps3Q91VB4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hps3Q91VB4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hps3Q91VB4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Hps3Q91VB4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hps3Q91VB4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hps3Q91VB4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hps3Q91VB4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hps3Q91VB4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hps3Q91VB4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hps3Q91VB4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hps3Q91VB4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hps3Q91VB4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hps3Q91VB4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hps3Q91VB4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hps3Q91VB4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hps3Q91VB4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hps3Q91VB4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hps3Q91VB4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Hps3Q91VB4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hps3Q91VB4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hps3Q91VB4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hps3Q91VB4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hps3Q91VB4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hps3Q91VB4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hps3Q91VB4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hps3Q91VB4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hps3Q91VB4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hps3Q91VB4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hps3Q91VB4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hps3Q91VB4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hps3Q91VB4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hps3Q91VB4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hps3Q91VB4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 465 ms