Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM1

Rnf130, E3 ubiquitin-protein ligase RNF130, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf130Q8VEM1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf130Q8VEM1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf130Q8VEM1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf130Q8VEM1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf130Q8VEM1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf130Q8VEM1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf130Q8VEM1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf130Q8VEM1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf130Q8VEM1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf130Q8VEM1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf130Q8VEM1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf130Q8VEM1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf130Q8VEM1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf130Q8VEM1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf130Q8VEM1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf130Q8VEM1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf130Q8VEM1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf130Q8VEM1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf130Q8VEM1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf130Q8VEM1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf130Q8VEM1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf130Q8VEM1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf130Q8VEM1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf130Q8VEM1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf130Q8VEM1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf130Q8VEM1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf130Q8VEM1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf130Q8VEM1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf130Q8VEM1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf130Q8VEM1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf130Q8VEM1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf130Q8VEM1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf130Q8VEM1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf130Q8VEM1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf130Q8VEM1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf130Q8VEM1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf130Q8VEM1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf130Q8VEM1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf130Q8VEM1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf130Q8VEM1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf130Q8VEM1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf130Q8VEM1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf130Q8VEM1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf130Q8VEM1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf130Q8VEM1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf130Q8VEM1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf130Q8VEM1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf130Q8VEM1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf130Q8VEM1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf130Q8VEM1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf130Q8VEM1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf130Q8VEM1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf130Q8VEM1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf130Q8VEM1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf130Q8VEM1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf130Q8VEM1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf130Q8VEM1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf130Q8VEM1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf130Q8VEM1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf130Q8VEM1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf130Q8VEM1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf130Q8VEM1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf130Q8VEM1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf130Q8VEM1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf130Q8VEM1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf130Q8VEM1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf130Q8VEM1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf130Q8VEM1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf130Q8VEM1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf130Q8VEM1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf130Q8VEM1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf130Q8VEM1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf130Q8VEM1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf130Q8VEM1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf130Q8VEM1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf130Q8VEM1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf130Q8VEM1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf130Q8VEM1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf130Q8VEM1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf130Q8VEM1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf130Q8VEM1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf130Q8VEM1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf130Q8VEM1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf130Q8VEM1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf130Q8VEM1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf130Q8VEM1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf130Q8VEM1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf130Q8VEM1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf130Q8VEM1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf130Q8VEM1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf130Q8VEM1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf130Q8VEM1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf130Q8VEM1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf130Q8VEM1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf130Q8VEM1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf130Q8VEM1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf130Q8VEM1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf130Q8VEM1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf130Q8VEM1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf130Q8VEM1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms