Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Cul7Q8VE73 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Cul7Q8VE73 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Cul7Q8VE73 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Cul7Q8VE73 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Cul7Q8VE73 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Cul7Q8VE73 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Cul7Q8VE73 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Cul7Q8VE73 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Cul7Q8VE73 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
Cul7Q8VE73 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Cul7Q8VE73 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Cul7Q8VE73 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Cul7Q8VE73 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Cul7Q8VE73 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Cul7Q8VE73 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Cul7Q8VE73 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Cul7Q8VE73 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Cul7Q8VE73 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Cul7Q8VE73 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Cul7Q8VE73 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Cul7Q8VE73 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Cul7Q8VE73 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Cul7Q8VE73 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Cul7Q8VE73 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Cul7Q8VE73 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Cul7Q8VE73 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Cul7Q8VE73 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
Cul7Q8VE73 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
Cul7Q8VE73 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Cul7Q8VE73 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
Cul7Q8VE73 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
Cul7Q8VE73 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Cul7Q8VE73 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Cul7Q8VE73 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Cul7Q8VE73 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Cul7Q8VE73 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Cul7Q8VE73 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Cul7Q8VE73 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Cul7Q8VE73 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Cul7Q8VE73 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC37.32■■■■□ 3.57
Cul7Q8VE73 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Cul7Q8VE73 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Cul7Q8VE73 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Cul7Q8VE73 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Cul7Q8VE73 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Cul7Q8VE73 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Cul7Q8VE73 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
Cul7Q8VE73 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Cul7Q8VE73 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Cul7Q8VE73 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Cul7Q8VE73 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Cul7Q8VE73 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Cul7Q8VE73 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Cul7Q8VE73 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
Cul7Q8VE73 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Cul7Q8VE73 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
Cul7Q8VE73 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Cul7Q8VE73 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Cul7Q8VE73 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Cul7Q8VE73 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Cul7Q8VE73 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
Cul7Q8VE73 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
Cul7Q8VE73 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Cul7Q8VE73 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Cul7Q8VE73 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Cul7Q8VE73 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Cul7Q8VE73 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Cul7Q8VE73 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Cul7Q8VE73 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Cul7Q8VE73 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Cul7Q8VE73 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Cul7Q8VE73 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Cul7Q8VE73 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Cul7Q8VE73 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Cul7Q8VE73 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Cul7Q8VE73 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Cul7Q8VE73 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Cul7Q8VE73 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Cul7Q8VE73 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Cul7Q8VE73 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Cul7Q8VE73 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Cul7Q8VE73 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Cul7Q8VE73 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Cul7Q8VE73 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Cul7Q8VE73 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Cul7Q8VE73 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Cul7Q8VE73 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Cul7Q8VE73 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Cul7Q8VE73 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Cul7Q8VE73 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
Cul7Q8VE73 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Cul7Q8VE73 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Cul7Q8VE73 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
Cul7Q8VE73 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Cul7Q8VE73 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Cul7Q8VE73 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Cul7Q8VE73 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Cul7Q8VE73 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Cul7Q8VE73 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms