Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCK5

Klhl20, Kelch-like protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl20Q8VCK5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Klhl20Q8VCK5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Klhl20Q8VCK5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Klhl20Q8VCK5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Klhl20Q8VCK5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Klhl20Q8VCK5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Klhl20Q8VCK5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Klhl20Q8VCK5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Klhl20Q8VCK5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Klhl20Q8VCK5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Klhl20Q8VCK5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Klhl20Q8VCK5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Klhl20Q8VCK5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Klhl20Q8VCK5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Klhl20Q8VCK5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Klhl20Q8VCK5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Klhl20Q8VCK5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Klhl20Q8VCK5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Klhl20Q8VCK5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Klhl20Q8VCK5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Klhl20Q8VCK5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Klhl20Q8VCK5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Klhl20Q8VCK5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Klhl20Q8VCK5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Klhl20Q8VCK5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Klhl20Q8VCK5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Klhl20Q8VCK5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Klhl20Q8VCK5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Klhl20Q8VCK5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Klhl20Q8VCK5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klhl20Q8VCK5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klhl20Q8VCK5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klhl20Q8VCK5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klhl20Q8VCK5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klhl20Q8VCK5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klhl20Q8VCK5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klhl20Q8VCK5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klhl20Q8VCK5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Klhl20Q8VCK5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Klhl20Q8VCK5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Klhl20Q8VCK5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Klhl20Q8VCK5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Klhl20Q8VCK5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klhl20Q8VCK5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klhl20Q8VCK5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klhl20Q8VCK5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhl20Q8VCK5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhl20Q8VCK5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Klhl20Q8VCK5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Klhl20Q8VCK5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Klhl20Q8VCK5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Klhl20Q8VCK5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Klhl20Q8VCK5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Klhl20Q8VCK5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Klhl20Q8VCK5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Klhl20Q8VCK5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Klhl20Q8VCK5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Klhl20Q8VCK5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Klhl20Q8VCK5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klhl20Q8VCK5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klhl20Q8VCK5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Klhl20Q8VCK5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Klhl20Q8VCK5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Klhl20Q8VCK5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Klhl20Q8VCK5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Klhl20Q8VCK5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Klhl20Q8VCK5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klhl20Q8VCK5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Klhl20Q8VCK5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Klhl20Q8VCK5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Klhl20Q8VCK5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Klhl20Q8VCK5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klhl20Q8VCK5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klhl20Q8VCK5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klhl20Q8VCK5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klhl20Q8VCK5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klhl20Q8VCK5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Klhl20Q8VCK5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Klhl20Q8VCK5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Klhl20Q8VCK5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Klhl20Q8VCK5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Klhl20Q8VCK5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Klhl20Q8VCK5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Klhl20Q8VCK5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Klhl20Q8VCK5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Klhl20Q8VCK5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Klhl20Q8VCK5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Klhl20Q8VCK5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Klhl20Q8VCK5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Klhl20Q8VCK5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Klhl20Q8VCK5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klhl20Q8VCK5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Klhl20Q8VCK5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Klhl20Q8VCK5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Klhl20Q8VCK5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Klhl20Q8VCK5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Klhl20Q8VCK5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Klhl20Q8VCK5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Klhl20Q8VCK5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Klhl20Q8VCK5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms