Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C1

Uncharacterized protein C2orf42 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R3C1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q8R3C1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q8R3C1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8R3C1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8R3C1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8R3C1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q8R3C1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q8R3C1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8R3C1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8R3C1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8R3C1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8R3C1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8R3C1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8R3C1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8R3C1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8R3C1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q8R3C1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q8R3C1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q8R3C1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q8R3C1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q8R3C1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8R3C1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8R3C1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8R3C1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8R3C1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8R3C1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8R3C1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8R3C1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8R3C1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8R3C1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8R3C1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8R3C1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8R3C1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8R3C1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8R3C1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8R3C1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8R3C1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8R3C1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8R3C1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8R3C1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8R3C1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8R3C1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8R3C1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8R3C1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8R3C1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8R3C1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8R3C1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q8R3C1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q8R3C1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8R3C1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8R3C1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8R3C1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8R3C1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8R3C1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8R3C1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8R3C1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8R3C1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8R3C1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8R3C1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8R3C1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8R3C1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8R3C1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8R3C1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8R3C1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8R3C1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8R3C1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8R3C1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8R3C1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8R3C1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q8R3C1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8R3C1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8R3C1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8R3C1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8R3C1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8R3C1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8R3C1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8R3C1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8R3C1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8R3C1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8R3C1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8R3C1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8R3C1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8R3C1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8R3C1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8R3C1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8R3C1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8R3C1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8R3C1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8R3C1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8R3C1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8R3C1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q8R3C1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8R3C1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8R3C1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8R3C1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8R3C1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8R3C1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8R3C1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8R3C1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8R3C1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms