Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3B7

Brd8, Bromodomain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd8Q8R3B7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brd8Q8R3B7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Brd8Q8R3B7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brd8Q8R3B7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brd8Q8R3B7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brd8Q8R3B7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Brd8Q8R3B7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brd8Q8R3B7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brd8Q8R3B7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brd8Q8R3B7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brd8Q8R3B7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brd8Q8R3B7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brd8Q8R3B7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brd8Q8R3B7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brd8Q8R3B7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brd8Q8R3B7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brd8Q8R3B7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brd8Q8R3B7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brd8Q8R3B7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brd8Q8R3B7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brd8Q8R3B7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brd8Q8R3B7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brd8Q8R3B7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brd8Q8R3B7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brd8Q8R3B7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brd8Q8R3B7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brd8Q8R3B7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brd8Q8R3B7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brd8Q8R3B7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brd8Q8R3B7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brd8Q8R3B7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brd8Q8R3B7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd8Q8R3B7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd8Q8R3B7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd8Q8R3B7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd8Q8R3B7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brd8Q8R3B7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brd8Q8R3B7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brd8Q8R3B7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brd8Q8R3B7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brd8Q8R3B7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Brd8Q8R3B7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brd8Q8R3B7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brd8Q8R3B7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brd8Q8R3B7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Brd8Q8R3B7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brd8Q8R3B7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brd8Q8R3B7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brd8Q8R3B7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brd8Q8R3B7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brd8Q8R3B7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brd8Q8R3B7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brd8Q8R3B7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brd8Q8R3B7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brd8Q8R3B7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brd8Q8R3B7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brd8Q8R3B7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd8Q8R3B7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd8Q8R3B7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd8Q8R3B7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd8Q8R3B7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brd8Q8R3B7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brd8Q8R3B7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brd8Q8R3B7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Brd8Q8R3B7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brd8Q8R3B7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brd8Q8R3B7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brd8Q8R3B7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brd8Q8R3B7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brd8Q8R3B7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brd8Q8R3B7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brd8Q8R3B7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brd8Q8R3B7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brd8Q8R3B7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brd8Q8R3B7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brd8Q8R3B7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brd8Q8R3B7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brd8Q8R3B7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brd8Q8R3B7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brd8Q8R3B7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brd8Q8R3B7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brd8Q8R3B7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brd8Q8R3B7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brd8Q8R3B7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brd8Q8R3B7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brd8Q8R3B7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brd8Q8R3B7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brd8Q8R3B7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Brd8Q8R3B7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Brd8Q8R3B7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brd8Q8R3B7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brd8Q8R3B7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Brd8Q8R3B7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brd8Q8R3B7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brd8Q8R3B7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brd8Q8R3B7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brd8Q8R3B7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brd8Q8R3B7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brd8Q8R3B7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brd8Q8R3B7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms