Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CipcQ8R0W1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CipcQ8R0W1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CipcQ8R0W1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CipcQ8R0W1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CipcQ8R0W1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CipcQ8R0W1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CipcQ8R0W1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CipcQ8R0W1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CipcQ8R0W1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CipcQ8R0W1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CipcQ8R0W1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CipcQ8R0W1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CipcQ8R0W1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CipcQ8R0W1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CipcQ8R0W1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CipcQ8R0W1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CipcQ8R0W1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CipcQ8R0W1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CipcQ8R0W1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CipcQ8R0W1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CipcQ8R0W1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CipcQ8R0W1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CipcQ8R0W1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CipcQ8R0W1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CipcQ8R0W1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CipcQ8R0W1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CipcQ8R0W1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CipcQ8R0W1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CipcQ8R0W1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CipcQ8R0W1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CipcQ8R0W1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CipcQ8R0W1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CipcQ8R0W1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CipcQ8R0W1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CipcQ8R0W1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CipcQ8R0W1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CipcQ8R0W1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CipcQ8R0W1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CipcQ8R0W1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CipcQ8R0W1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CipcQ8R0W1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CipcQ8R0W1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CipcQ8R0W1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CipcQ8R0W1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CipcQ8R0W1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CipcQ8R0W1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CipcQ8R0W1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CipcQ8R0W1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CipcQ8R0W1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CipcQ8R0W1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CipcQ8R0W1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CipcQ8R0W1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CipcQ8R0W1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CipcQ8R0W1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CipcQ8R0W1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CipcQ8R0W1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CipcQ8R0W1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CipcQ8R0W1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CipcQ8R0W1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CipcQ8R0W1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CipcQ8R0W1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CipcQ8R0W1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CipcQ8R0W1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CipcQ8R0W1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CipcQ8R0W1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CipcQ8R0W1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CipcQ8R0W1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CipcQ8R0W1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CipcQ8R0W1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CipcQ8R0W1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CipcQ8R0W1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CipcQ8R0W1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CipcQ8R0W1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CipcQ8R0W1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CipcQ8R0W1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CipcQ8R0W1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CipcQ8R0W1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CipcQ8R0W1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CipcQ8R0W1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CipcQ8R0W1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CipcQ8R0W1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CipcQ8R0W1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CipcQ8R0W1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CipcQ8R0W1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CipcQ8R0W1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CipcQ8R0W1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CipcQ8R0W1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CipcQ8R0W1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CipcQ8R0W1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CipcQ8R0W1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CipcQ8R0W1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CipcQ8R0W1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CipcQ8R0W1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CipcQ8R0W1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CipcQ8R0W1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CipcQ8R0W1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CipcQ8R0W1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CipcQ8R0W1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CipcQ8R0W1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms