Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Colec12Q8K4Q8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Colec12Q8K4Q8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Colec12Q8K4Q8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Colec12Q8K4Q8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Colec12Q8K4Q8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Colec12Q8K4Q8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Colec12Q8K4Q8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Colec12Q8K4Q8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Colec12Q8K4Q8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Colec12Q8K4Q8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Colec12Q8K4Q8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Colec12Q8K4Q8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Colec12Q8K4Q8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Colec12Q8K4Q8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Colec12Q8K4Q8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Colec12Q8K4Q8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Colec12Q8K4Q8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Colec12Q8K4Q8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Colec12Q8K4Q8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Colec12Q8K4Q8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Colec12Q8K4Q8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Colec12Q8K4Q8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Colec12Q8K4Q8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Colec12Q8K4Q8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Colec12Q8K4Q8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Colec12Q8K4Q8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Colec12Q8K4Q8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Colec12Q8K4Q8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Colec12Q8K4Q8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Colec12Q8K4Q8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Colec12Q8K4Q8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Colec12Q8K4Q8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Colec12Q8K4Q8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Colec12Q8K4Q8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Colec12Q8K4Q8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Colec12Q8K4Q8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Colec12Q8K4Q8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Colec12Q8K4Q8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Colec12Q8K4Q8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Colec12Q8K4Q8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Colec12Q8K4Q8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Colec12Q8K4Q8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Colec12Q8K4Q8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Colec12Q8K4Q8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Colec12Q8K4Q8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Colec12Q8K4Q8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Colec12Q8K4Q8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Colec12Q8K4Q8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Colec12Q8K4Q8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Colec12Q8K4Q8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Colec12Q8K4Q8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Colec12Q8K4Q8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Colec12Q8K4Q8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Colec12Q8K4Q8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Colec12Q8K4Q8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Colec12Q8K4Q8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Colec12Q8K4Q8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Colec12Q8K4Q8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Colec12Q8K4Q8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Colec12Q8K4Q8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Colec12Q8K4Q8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Colec12Q8K4Q8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Colec12Q8K4Q8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Colec12Q8K4Q8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Colec12Q8K4Q8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Colec12Q8K4Q8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Colec12Q8K4Q8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Colec12Q8K4Q8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Colec12Q8K4Q8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Colec12Q8K4Q8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Colec12Q8K4Q8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Colec12Q8K4Q8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Colec12Q8K4Q8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Colec12Q8K4Q8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Colec12Q8K4Q8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Colec12Q8K4Q8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Colec12Q8K4Q8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Colec12Q8K4Q8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Colec12Q8K4Q8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Colec12Q8K4Q8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Colec12Q8K4Q8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Colec12Q8K4Q8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Colec12Q8K4Q8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Colec12Q8K4Q8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Colec12Q8K4Q8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Colec12Q8K4Q8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Colec12Q8K4Q8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Colec12Q8K4Q8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Colec12Q8K4Q8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Colec12Q8K4Q8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Colec12Q8K4Q8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Colec12Q8K4Q8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Colec12Q8K4Q8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Colec12Q8K4Q8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Colec12Q8K4Q8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Colec12Q8K4Q8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Colec12Q8K4Q8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Colec12Q8K4Q8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Colec12Q8K4Q8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms