Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnot6Q8K3P5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnot6Q8K3P5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnot6Q8K3P5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnot6Q8K3P5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnot6Q8K3P5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnot6Q8K3P5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnot6Q8K3P5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnot6Q8K3P5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnot6Q8K3P5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnot6Q8K3P5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnot6Q8K3P5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnot6Q8K3P5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnot6Q8K3P5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnot6Q8K3P5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnot6Q8K3P5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnot6Q8K3P5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnot6Q8K3P5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnot6Q8K3P5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnot6Q8K3P5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnot6Q8K3P5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnot6Q8K3P5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnot6Q8K3P5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnot6Q8K3P5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnot6Q8K3P5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnot6Q8K3P5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnot6Q8K3P5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnot6Q8K3P5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnot6Q8K3P5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnot6Q8K3P5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnot6Q8K3P5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnot6Q8K3P5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnot6Q8K3P5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnot6Q8K3P5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cnot6Q8K3P5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cnot6Q8K3P5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnot6Q8K3P5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnot6Q8K3P5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot6Q8K3P5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot6Q8K3P5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot6Q8K3P5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot6Q8K3P5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot6Q8K3P5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot6Q8K3P5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnot6Q8K3P5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnot6Q8K3P5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnot6Q8K3P5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnot6Q8K3P5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnot6Q8K3P5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnot6Q8K3P5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnot6Q8K3P5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnot6Q8K3P5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnot6Q8K3P5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnot6Q8K3P5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnot6Q8K3P5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnot6Q8K3P5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnot6Q8K3P5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnot6Q8K3P5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnot6Q8K3P5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnot6Q8K3P5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnot6Q8K3P5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnot6Q8K3P5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnot6Q8K3P5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnot6Q8K3P5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnot6Q8K3P5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnot6Q8K3P5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnot6Q8K3P5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnot6Q8K3P5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnot6Q8K3P5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnot6Q8K3P5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnot6Q8K3P5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnot6Q8K3P5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnot6Q8K3P5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnot6Q8K3P5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnot6Q8K3P5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnot6Q8K3P5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnot6Q8K3P5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnot6Q8K3P5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnot6Q8K3P5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cnot6Q8K3P5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnot6Q8K3P5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cnot6Q8K3P5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnot6Q8K3P5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnot6Q8K3P5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnot6Q8K3P5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnot6Q8K3P5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnot6Q8K3P5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnot6Q8K3P5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnot6Q8K3P5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnot6Q8K3P5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnot6Q8K3P5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnot6Q8K3P5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnot6Q8K3P5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnot6Q8K3P5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnot6Q8K3P5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnot6Q8K3P5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnot6Q8K3P5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnot6Q8K3P5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnot6Q8K3P5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnot6Q8K3P5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms