Protein–RNA interactions for Protein: Q8K301

Ddx52, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX52, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx52Q8K301 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx52Q8K301 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddx52Q8K301 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddx52Q8K301 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddx52Q8K301 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ddx52Q8K301 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx52Q8K301 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx52Q8K301 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx52Q8K301 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx52Q8K301 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx52Q8K301 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx52Q8K301 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx52Q8K301 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx52Q8K301 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx52Q8K301 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx52Q8K301 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx52Q8K301 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx52Q8K301 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx52Q8K301 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx52Q8K301 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx52Q8K301 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx52Q8K301 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx52Q8K301 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx52Q8K301 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddx52Q8K301 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddx52Q8K301 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddx52Q8K301 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx52Q8K301 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx52Q8K301 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx52Q8K301 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx52Q8K301 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx52Q8K301 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx52Q8K301 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx52Q8K301 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx52Q8K301 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx52Q8K301 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx52Q8K301 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx52Q8K301 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx52Q8K301 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx52Q8K301 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx52Q8K301 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx52Q8K301 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx52Q8K301 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx52Q8K301 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx52Q8K301 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ddx52Q8K301 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx52Q8K301 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx52Q8K301 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx52Q8K301 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx52Q8K301 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx52Q8K301 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx52Q8K301 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx52Q8K301 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx52Q8K301 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx52Q8K301 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx52Q8K301 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx52Q8K301 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx52Q8K301 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx52Q8K301 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx52Q8K301 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx52Q8K301 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx52Q8K301 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx52Q8K301 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx52Q8K301 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx52Q8K301 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx52Q8K301 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx52Q8K301 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx52Q8K301 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx52Q8K301 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx52Q8K301 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx52Q8K301 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx52Q8K301 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx52Q8K301 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx52Q8K301 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx52Q8K301 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx52Q8K301 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx52Q8K301 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx52Q8K301 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx52Q8K301 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx52Q8K301 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx52Q8K301 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx52Q8K301 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx52Q8K301 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx52Q8K301 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx52Q8K301 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx52Q8K301 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx52Q8K301 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx52Q8K301 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx52Q8K301 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx52Q8K301 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx52Q8K301 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx52Q8K301 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx52Q8K301 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx52Q8K301 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx52Q8K301 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx52Q8K301 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx52Q8K301 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx52Q8K301 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx52Q8K301 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx52Q8K301 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms